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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003055`

染色体: Chr03 坐标: 47452532-47455079 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003055`
名称	SmilChr03G003055
描述	protein WHAT'S THIS FACTOR 1 homolog, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	47452532 - 47455079 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016203`
GeneID	`131016203`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016203`
原始查询	`LOC131016203`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein WHAT'S THIS FACTOR 1 homolog, chloroplastic
产物	protein WHAT'S THIS FACTOR 1 homolog%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G63090` (AT3G63090) Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825484] identity=66.6; qcov=0.921; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0293200` - identity=49.6; qcov=0.929; evalue=1.97e-121; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF11955 (PORR)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016203

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057800825.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800825.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800825.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800825.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800825.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:47452753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B46,C76
`Chr3:47452832`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,C31
`Chr3:47452880`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,C15,C20
`Chr3:47452937`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:47453191`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,B53
`Chr3:47453356`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr3:47453549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr3:47453584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B117,B53
`Chr3:47453725`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr3:47453856`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,A6,B11,B89
`Chr3:47453864`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B25,B76,B95,C53
`Chr3:47453864`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B25,B76,B95,C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800825.1

406 aa

203

406

PORR

PF11955 PORR 40-369 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800825.1`	Pfam	`PF11955`	PORR	Family	40	369	6.5e-106	354.7	Plant organelle RNA recognition domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944842.1
AGATGATAAATTAGTGAAATGATTGTAACTTTGTGTTTGCGCTATAAATCGTTTTCGAATATAAATTCATATTTTCGTAGTATTTGCCTGGAAAGAACTCATCGCTGCTAAATTCAAAATAAAACCCTAGCTTCCAATTTCATCAAAATACCCAAAATGCTATCAAAATCCAGACGTTTATTCATGTTTCGAGCCCATAATCCGAAGATTCCTTCTCTCTACTCCATCCTCCAATTCAATGCTTCAATGTCAAACCTAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016203
ATGCTATCAAAATCCAGACGTTTATTCATGTTTCGAGCCCATAATCCGAAGATTCCTTCTCTCTACTCCATCCTCCAATTCAATGCTTCAATGTCAAACCTAAAAGTGGTATGGCGAAAGGATACGAAACTCGATCAAGCAATCGAGAACGACAAGAAATGGCGGCTCTGCTACCGGGTCGTCCGAGAAGTCCTAAACGAACCGGGTCAGGTAATCCCGCTCCAATACTTAGCTAAACGCCGCGAGCGGCTTCGGTTGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800825.1
MLSKSRRLFMFRAHNPKIPSLYSILQFNASMSNLKVVWRKDTKLDQAIENDKKWRLCYRVVREVLNEPGQVIPLQYLAKRRERLRLPVKLEAFLSQNPGLFDIYKDRIRPKSDLVEFVRPSDRLNRFSEEEKLIYRENEPLIVAKLCKLLMMANHRVVSAAKLVEVKKEFGFPNDFLVKLVSAYPEYFRLHGLPGEGQSYLELVSCNEEFAKSVIERRAEEESRLMGINVRPAFEWKLPPGFFFKKEMREWVRDWMELPY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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