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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003057`

染色体: Chr03 坐标: 47466730-47468618 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003057`
名称	SmilChr03G003057
描述	adenylate isopentenyltransferase 3, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	47466730 - 47468618 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016205`
GeneID	`131016205`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016205`
原始查询	`LOC131016205`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	adenylate isopentenyltransferase 3, chloroplastic
产物	adenylate isopentenyltransferase 3%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G63110` (IPT3) isopentenyltransferase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825486] identity=59.4; qcov=0.969; evalue=7.53e-122; confidence=high
Rice	`Os03g0810100` (OsIPT4) - identity=50.8; qcov=0.997; evalue=2.13e-91; confidence=high
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0006400 (tRNA modification); GO:0009691 (cytokinin biosynthetic process); GO:0052381 (tRNA dimethylallyltransferase activity)
KEGG	smil00908 (Zeatin biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01715 (IPPT); PF01745 (IPT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016205

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057800827.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057800827.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800827.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800827.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800827.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:47466972`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr3:47466997`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B11,B63,B89
`Chr3:47467188`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B46,C76
`Chr3:47467260`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,C45
`Chr3:47467390`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A18
`Chr3:47467390`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A18
`Chr3:47467561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:47467572`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,B12
`Chr3:47467868`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	177	A1,A10,A11,A13,A15,A16,A18,A20,A21,A22,A23,A25,A3,A4,A6,A7,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B11,B110,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B12,B122,B123,B124,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B17,B18,B2,B21,B22,B23,B25,B26,B28,B3,B31,B34,B36,B37,B40,B41,B44,B45,B46,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B57,B58,B6,B60,B61,B63,B65,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B76,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B87,B88,B89,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B98,C10,C11,C12,C13,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C24,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C34,C35,C36,C39,C45,C46,C47,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C57,C58,C59,C6,C61,C62,C63,C65,C67,C69,C7,C70,C72,C75,C76,C79,C80,C81,C82,C83,C85,C86,C87,D11,D3,D4,D5,D6,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800827.1

318 aa

159

318

IPT

IPPT

PF01745 IPT 33-159 aa PF01715 IPPT 67-139 aa PF01715 IPPT 143-242 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800827.1`	Pfam	`PF01745`	IPT	Domain	33	159	7e-09	36.2	Isopentenyl transferase
`XP_057800827.1`	Pfam	`PF01715`	IPPT	Domain	67	139	8.7e-38	131.1	IPP transferase
`XP_057800827.1`	Pfam	`PF01715`	IPPT	Domain	143	242	8.7e-38	131.1	IPP transferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944844.1
AAAGAATTCATGTTATTCTACTTCCATTAAAATTATTCTCTCAATCAACATACAAGAACAAGAATCGCATAGTACATTTTCTTCTCAAGATTCAGCACCTCACATTTCTTATGCATATGTTCAAATCTTAGGATAAAAATAGTAGAAATTGTAAACTCAACTGCAAAGTCCTCCTTTAGTAAAAGATGTTGACTTATTAATTAATCTACTTTCTTCTCCCAAGTTGATGCGAATCATTCAGGCTTTTAATTTACAATATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016205
ATGAAAATATCATTCTCTGCATCCAAACAAATACGCCCCTTGCTACACATACCTAGCACCTGCACTCAGCTCCTCCGCCACGGCCCGCCCAAGGAGAAGGTGGTGGTGGTGATGGGCGCCACCGGCGCCGGAAAATCGCGTCTCTCGATCGACCTCGCCACGAGCTTCTCGGCGGAGATCATCAACTCCGACAAAATGCAGGTCTACCAAGGCCTCGAAATCGCCACTAACAAAATCACCGACGAGGAGCTGCGCGGCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800827.1
MKISFSASKQIRPLLHIPSTCTQLLRHGPPKEKVVVVMGATGAGKSRLSIDLATSFSAEIINSDKMQVYQGLEIATNKITDEELRGVPHHLLGVIDPESDFSAANFRAMASISLQSILSRRQLPIIVGGSNSFVEALVDVNFQSRYDCCFLWVDVAMPVLHSFVSDRVDKMVERGMVDEVRAFFRSDADYSRGIRRAIGVPELDEFFRVESSCDEETRARVLAEAIDAIKMNTSRLACRQLEKIHRLRNIRDWRMHRLDA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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