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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003081`

染色体: Chr03 坐标: 47834112-47842494 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003081`
名称	SmilChr03G003081
描述	mitochondrial Rho GTPase 1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	47834112 - 47842494 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016225`
GeneID	`131016225`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016225`
原始查询	`LOC131016225`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitochondrial Rho GTPase 1-like
产物	mitochondrial Rho GTPase 1-like
Arabidopsis	`AT3G63150` (MIRO2) MIRO-related GTP-ase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825490] identity=60.5; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0810600` (OSJNBa0028F23.7) - identity=63.4; qcov=0.986; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0005525 (GTP binding); GO:0005741 (mitochondrial outer membrane); GO:0007005 (mitochondrion organization); GO:0007264 (small GTPase-mediated signal transduction); GO:0010821 (regulation of mitochondrion organization)
KEGG	-
Pfam	PF00071 (Ras); PF08355 (EF_assoc_1); PF08356 (EF_assoc_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016225

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.60000	`XP_057800850.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057800850.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800850.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800850.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800850.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:47834820`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B87
`Chr3:47835549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,C80
`Chr3:47835550`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,C80
`Chr3:47835832`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:47836271`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C27
`Chr3:47836271`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C27
`Chr3:47836273`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr3:47839721`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,B2
`Chr3:47839869`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr3:47841112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr3:47841235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B14,C5,C81
`Chr3:47841444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B139,B55,B60,C80,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800850.1

642 aa

321

642

Ras

EF_assoc_2

EF_assoc_1

Ras

PF00071 Ras 16-174 aa PF08356 EF_assoc_2 228-312 aa PF08355 EF_assoc_1 349-417 aa PF00071 Ras 426-587 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800850.1`	Pfam	`PF00071`	Ras	Domain	16	174	4.1e-20	72.7	Ras family
`XP_057800850.1`	Pfam	`PF08356`	EF_assoc_2	Family	228	312	1.5e-30	105.8	EF hand associated
`XP_057800850.1`	Pfam	`PF08355`	EF_assoc_1	Family	349	417	9.2e-21	73.9	EF hand associated
`XP_057800850.1`	Pfam	`PF00071`	Ras	Domain	426	587	4.1e-20	72.7	Ras family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944867.1
AATGTTACCTCCTTTTTTGAAAAAGAGAAAAAGAAAACAGCATTTTGATATTAGATTCTTAGGCCTTACGAGTACTTGTTTTCATTTATTTTTCAGTATGTTTTTTAATTAAGTTTAATAAAATCTGTTAAGGATTTTTTATTTAAATTAATATCAAATGTTTCTTGAAAAAAAGTTAAAGAATAGAGATGCATGGGCAGCATGGCTGTACAATTTATTCATAACGTAAATTAATAATTTTCACCTTTAACTTTAATGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016225
ATGCCAGGTGGCGGTGCAACCTCCGGCACTCGCACGAGCGTCCGAATCGCCGTCATCGGCGACCGCGGCACCGGCAAATCCAGCCTCATCGCCGCCGCCGCCGCCGAGTCGTTCCGCCCCGAAGTTCCTCCTGTCCTCCCTCCCACTCGTCTACCATCCGATTATTACCCCGATAACGTCCCCATCATCATCATCGACACCTCCAGCAGTTTGGAGTATAGAGGGAAGCTTGCTGAGGAATTGAAGCGCGCCGATGCTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800850.1
MPGGGATSGTRTSVRIAVIGDRGTGKSSLIAAAAAESFRPEVPPVLPPTRLPSDYYPDNVPIIIIDTSSSLEYRGKLAEELKRADAVVLTYACDQPLTLNRLSTFWLHELRRLEIRAPVIVAGCKLDRRDEEYNLSVEMMPLMQQFREIETCIECSAANMLQIQEVFYFAQKAVLHPTAPLFDQETQALRPRCMRALKRIFILCDLDMDGALNDDELNEFQVKCFNSPLQPAEVVGVKSVVREKLPEGVNELGLTLTGFL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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