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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003097`

染色体: Chr03 坐标: 48018152-48026537 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003097`
名称	SmilChr03G003097
描述	ribosome-recycling factor, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	48018152 - 48026537 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016240`
GeneID	`131016240`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016240`
原始查询	`LOC131016240`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ribosome-recycling factor, chloroplastic
产物	ribosome-recycling factor%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G63190` (RRF) ribosome recycling factor, chloroplast [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825494] identity=70.3; qcov=0.977; evalue=2.8e-118; confidence=high
Rice	`Os07g0570700` - identity=70.4; qcov=0.878; evalue=6.95e-113; confidence=high
GO	GO:0009507 (chloroplast); GO:0032544 (plastid translation); GO:0043023 (ribosomal large subunit binding)
KEGG	-
Pfam	PF01765 (RRF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016240

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057800878.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057800878.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800878.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800878.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800878.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:48018481`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B9,B97,C50,C73
`Chr3:48018674`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr3:48018680`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B111,B17
`Chr3:48018697`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr3:48018710`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,B28

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800878.1

262 aa

131

262

RRF

PF01765 RRF 98-260 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800878.1`	Pfam	`PF01765`	RRF	Domain	98	260	6.4e-65	218.7	Ribosome recycling factor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944895.1
ACTAATTTTTGTTTATGTATGTTGACAACTTAAGAAATCAAAAGGATAGACACTCAAGTAAAATTTCATAAATTTATAATTGTTGTCGATGCATATTCATTAAATGGAAAATGTCGCACAATTTCACAATAGAAGTTAGTTTTTGCACATACAATATAAAAAAAAGAAAGAAAAAACAATTGGCGCATTTTGTGGATGAATGATATATCGGTCTTATCCACAATGCAGTGCAAGTGTGTAACTAACTTACAATAAAACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016240
ATGGCGACCAACTTCTCGCCTGTTTCTCACTTACGCTCCATCTTCTACGCCTCCATTGCTCCAAATACTCGCCCCTCATTCACAGATTTAAGAAATGCGCGTTCATGGAGTGCGTCGGCGAATTACGTCAAGCTTCACGTGGCGGCGAGAGCCAAACCCGTATTTATCAAGCACGCAGTAAAGAAGAGAATGGGAGTGTTGAGGTGTGCAACCCTCGAGGAAATAGAAGCGGAGAAGTCAATGATTGAGGAAGATGCTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800878.1
MATNFSPVSHLRSIFYASIAPNTRPSFTDLRNARSWSASANYVKLHVAARAKPVFIKHAVKKRMGVLRCATLEEIEAEKSMIEEDAKERMEKTIENVKSSFNSIRTGRANPAILDKIEVEYYGTPVVLKSIAQISTPDASSLLVQPYDKSSLKSIEKAIVNSDLGMTPNNDGDVIRLSMPQLTSDRRKELSKVVAKQAEEGKVAIRNIRRDAIKSYEKLEKEKKLSEDNVKDLSADLQKVTDEYMKKIESIYKQKEKELL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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