当前解析结果
SmilChr03G003108| 统一新 Gene ID | SmilChr03G003108 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G003108 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G003108 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 48208721 - 48213064 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131016252 |
|---|---|
| GeneID | 131016252 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131016252 |
| 原始查询 | LOC131016252 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | Mtr1; symbol=Mtr1; hit=Os02g0491300; species=rice; confidence=low |
| 产物 | Mtr1; symbol=Mtr1; hit=Os02g0491300; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | AT5G40940 (FLA20)putative fasciclin-like arabinogalactan protein 20 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834095] identity=26.3; qcov=1.07; evalue=1.64e-10; confidence=low |
| Rice | Os02g0491300 (Mtr1)- identity=34; qcov=0.919; evalue=1.79e-41; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131016252 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 1.00000 | XP_057800887.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057800887.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057800887.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057800887.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057800887.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:48210161 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D6 |
Chr3:48210208 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B27,B75,C33,C55 |
Chr3:48210327 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C8 |
Chr3:48210429 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B19,B21,C28,C74,D11 |
Chr3:48210610 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B101,B104 |
Chr3:48210825 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B101 |
Chr3:48210831 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B27,B75,C33,C55 |
Chr3:48211025 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B117,B53 |
Chr3:48211029 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C75 |
Chr3:48211158 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B101 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。