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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003110`

染色体: Chr03 坐标: 48232517-48234374 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003110`
名称	SmilChr03G003110
描述	uncharacterized SmilChr03G003110
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	48232517 - 48234374 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016255`
GeneID	`131016255`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016255`
原始查询	`LOC131016255`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ras-induced vulval development antagonist protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828193]; symbol=AT4G02720; hit=AT4G02720; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ras-induced vulval development antagonist protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828193]; symbol=AT4G02720; hit=AT4G02720; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G02720` (AT4G02720) Ras-induced vulval development antagonist protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828193] identity=81.1; qcov=0.311; evalue=7e-83; confidence=low
Rice	`Os09g0455400` - identity=91.5; qcov=0.139; evalue=1.07e-40; confidence=weak
GO	GO:0003682 (chromatin binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0010468 (regulation of gene expression)
KEGG	-
Pfam	PF06047 (Nkap_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016255

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057800891.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057800891.1`
3	Nuclear speckle	核斑点	0.60000	`XP_057800891.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800891.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800891.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:48232816`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr3:48233101`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr3:48233107`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,B53
`Chr3:48233211`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B46,B94,D5
`Chr3:48233212`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr3:48233335`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:48233426`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:48233462`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:48233788`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:48233820`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:48234095`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,B28
`Chr3:48234101`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800891.1

512 aa

256

512

Nkap_C

PF06047 Nkap_C 390-488 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800891.1`	Pfam	`PF06047`	Nkap_C	Domain	390	488	7.1e-47	158.4	NF-kappa-B-activating protein C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944908.1
TACACTCGGCTCTCTCAAATCAAAGCCGTTCGCAATAGGCCCATATATTGAAACCCTCAAATTGAACTCGAAATCACAAAATCCCTAATTCTCTATTTCGTATCACTCTCAAATCCATTATGGGAAGAATTTCTTCCGCCGTACAAATCCCCGAGCGCCACCGCCATAGCGATAGATATTCCCCGGACTCCCGTAGCTATTCTCGGCGCAATCGAAGTTACAGCCGCAGCCGCAGTCCTAGCCCCATCCGCAGGCAAAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016255
ATGGGAAGAATTTCTTCCGCCGTACAAATCCCCGAGCGCCACCGCCATAGCGATAGATATTCCCCGGACTCCCGTAGCTATTCTCGGCGCAATCGAAGTTACAGCCGCAGCCGCAGTCCTAGCCCCATCCGCAGGCAAAGTTTGAGCCGGAGCCGCGGCCGTAGTTTCAGCCGGAGCCGGAGCCGGAGCCCGACCGGAAATGGTTATGCCAGGTACCGTCGTTCTTCTCCGGATTACTCGTACCCTAGTCTAGAAGAAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800891.1
MGRISSAVQIPERHRHSDRYSPDSRSYSRRNRSYSRSRSPSPIRRQSLSRSRGRSFSRSRSRSPTGNGYARYRRSSPDYSYPSLEETRNSGERKKYNYDNRRTSYLDRDNRNEQHVESDSDEELKGLPYEEYRRLKRQKLRKSLKDCIWNCTPSPPRGPNENSDADLEEDFGGEDEKHIKGLKPEGKKPGESQSESEDSESESDDSRSRKGRKSVSRKKSRRSPSLSESGSGSEEESSSDDSEEDRRRRRRKSGRKSTRR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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