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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003116`

染色体: Chr03 坐标: 48289412-48291694 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003116`
名称	SmilChr03G003116
描述	40S ribosomal protein S18
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	48289412 - 48291694 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016261`
GeneID	`131016261`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016261`
原始查询	`LOC131016261`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	40S ribosomal protein S18
产物	40S ribosomal protein S18
Arabidopsis	`AT4G09800` (RPS18C) S18 ribosomal protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826569] identity=93.4; qcov=1; evalue=4.54e-105; confidence=high
Rice	`Os03g0794700` (RPS18) - identity=87.5; qcov=1; evalue=7.18e-101; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005829 (cytosol); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0015935 (small ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00416 (Ribosomal_S13)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016261

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057800893.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.60000	`XP_057800892.1`
3	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057800893.1`
4	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057800892.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800893.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:48289857`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B8
`Chr3:48291400`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	23	A1,A10,B113,B126,B127,B130,B132,B19,B2,B31,B44,B67,B73,B90,B92,B97,C12,C27,C38,C46,C59,C71,D9
`Chr3:48291445`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C21
`Chr3:48291445`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800892.1

167 aa

167

Ribosomal_S13

PF00416 Ribosomal_S13 14-118 aa

XP_057800893.1

152 aa

152

Ribosomal_S13

PF00416 Ribosomal_S13 14-142 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800892.1`	Pfam	`PF00416`	Ribosomal_S13	Family	14	118	3e-36	125.4	Ribosomal protein S13/S18
`XP_057800893.1`	Pfam	`PF00416`	Ribosomal_S13	Family	14	142	1.8e-54	184.3	Ribosomal protein S13/S18

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944910.1
ATGTCAAGACTATTATCTCCTCCTCCCACGCCAAAAGAAATACAGTAAAAGAGACTGCCTCTTAATATAGTTTTGTCTAATTATCGGGGCTAAAGTGCAAATTCTCCCAGTTCAATCTGCTATAAATTAAAAACCACGATTTAGGGTTTCTGTTCTCTCAAACTCACTCATAGCGGAGCAGCCGTCGAAGAACGTAAAATACCGCAGCTGCTCGATTCCAAACCCTAAAAATGTCTCTCGTAGCTAATGAAGATTTCCAG...

XM_057944909.1
TTGTCTAATTATCGGGGCTAAAGTGCAAATTCTCCCAGTTCAATCTGCTATAAATTAAAAACCACGATTTAGGGTTTCTGTTCTCTCAAACTCACTCATAGCGGAGCAGCCGTCGAAGAACGTAAAATACCGCAGCTGCTCGATTCCAAACCCTAAAAATGTCTCTCGTAGCTAATGAAGATTTCCAGCACATTCTGCGTGTGCAGAACACGAACGTGGACGGAAAGCAGAAGATCATGTTCGCCATGACCTCAATCAAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016261
ATGTCTCTCGTAGCTAATGAAGATTTCCAGCACATTCTGCGTGTGCAGAACACGAACGTGGACGGAAAGCAGAAGATCATGTTCGCCATGACCTCAATCAAGGGTATTGGTCGCCGTTTCGCCAACATCGTCTGCAAGAAAGCCGATGTTGATATGAACAAGAGGGCTGGTGAACTCTCTGCTGCTGAACTTGATAGCTTGATGGTTATTGTGGCAAACCCCCGTCAGTTCAAGATTCCCGACTGGTTTTTGAACAGGAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057800892.1
MSLVANEDFQHILRVQNTNVDGKQKIMFAMTSIKGIGRRFANIVCKKADVDMNKRAGELSAAELDSLMVIVANPRQFKIPDWFLNRKKDYKDGKFSQVTSNALDMKLRDDLERLKKIRYDFRFDPLFYIKVLLVSNCICVHYFQKPPWSPSLLGPSRAWTAHQDHWS

XP_057800893.1
MSLVANEDFQHILRVQNTNVDGKQKIMFAMTSIKGIGRRFANIVCKKADVDMNKRAGELSAAELDSLMVIVANPRQFKIPDWFLNRKKDYKDGKFSQVTSNALDMKLRDDLERLKKIRNHRGLRHYWGLRVRGQHTKTTGRRGKTVGVSKKR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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