当前解析结果
SmilChr03G003130| 统一新 Gene ID | SmilChr03G003130 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G003130 |
| 描述 | protein SPIRAL1-like 1 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 48484404 - 48487813 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131016284 |
|---|---|
| GeneID | 131016284 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131016284 |
| 原始查询 | LOC131016284 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein SPIRAL1-like 1 |
| 产物 | protein SPIRAL1-like 1 |
| Arabidopsis | AT1G26355 (SP1L1)SPIRAL1-like1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6240366] identity=71.9; qcov=0.991; evalue=3.32e-51; confidence=high |
| Rice | Os12g0502000- identity=53.7; qcov=0.826; evalue=5.64e-25; confidence=medium |
| GO | GO:0010005 (cortical microtubule, transverse to long axis); GO:0043622 (cortical microtubule organization) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131016284 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoskeleton | 细胞骨架 | 1.00000 | XP_057800921.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057800921.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057800921.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057800921.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057800921.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:48486810 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C8 |
Chr3:48487397 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C55,D8 |
Chr3:48487399 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B44,B98,C51,D4 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
5 records
下载 cDNA FASTA5 records
下载 CDS FASTA5 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。