当前解析结果
SmilChr03G003136| 统一新 Gene ID | SmilChr03G003136 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G003136 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G003136 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 48588548 - 48589566 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131016287 |
|---|---|
| GeneID | 131016287 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131016287 |
| 原始查询 | LOC131016287 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131016287 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057800927.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.40000 | XP_057800927.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057800927.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057800927.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057800927.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:48589156 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 65 | A16,A23,A3,A4,A8,B103,B119,B12,B124,B127,B13,B132,B133,B135,B138,B140,B27,B30,B36,B45,B48,B5,B52,B53,B54,B57,B59,B75,B82,B85,B87,B89,B91,B95,C1,C14,C16,C17,C18,C26,C3,C33,C34,C35,C38,C39,C48,C49,C51,C56,C59,C61,C62,C63,C67,C71,C76,C79,C85,C9,D1,D2,D7,D8,D9 |
Chr3:48589233 |
GAT |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | C17 |
Chr3:48589233 |
GAT |
G |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | C17 |
Chr3:48589266 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C20,C64,C66 |
Chr3:48589342 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B134,C10,C31 |
Chr3:48589509 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B79,C11 |
Chr3:48589509 |
AT |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | B79,C11 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。