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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003143`

染色体: Chr03 坐标: 48720038-48723193 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003143`
名称	SmilChr03G003143
描述	amino acid transporter AVT6C
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	48720038 - 48723193 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016294`
GeneID	`131016294`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016294`
原始查询	`LOC131016294`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	amino acid transporter AVT6C
产物	amino acid transporter AVT6C
Arabidopsis	`AT3G56200` (AT3G56200) Transmembrane amino acid transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824786] identity=60.4; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0825800` (OsATL7) - identity=56.2; qcov=0.993; evalue=2.58e-166; confidence=high
GO	GO:0003333 (amino acid transmembrane transport); GO:0015171 (amino acid transmembrane transporter activity)
KEGG	-
Pfam	PF01490 (Aa_trans); PF03222 (Trp_Tyr_perm)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016294

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057800939.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057800939.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057800939.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800939.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800939.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:48720916`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B86
`Chr3:48720916`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B86
`Chr3:48721710`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	A24,B131,B2,B28,B30,C23,C30,C41,C64,C66
`Chr3:48721745`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,C73,C81,D2
`Chr3:48722711`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B28
`Chr3:48722711`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B28
`Chr3:48722880`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr3:48722971`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,C41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800939.1

435 aa

218

435

Trp_Tyr_perm

Aa_trans

PF03222 Trp_Tyr_perm 25-276 aa PF01490 Aa_trans 29-425 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800939.1`	Pfam	`PF03222`	Trp_Tyr_perm	Family	25	276	6.5e-09	36.1	Tryptophan/tyrosine permease family
`XP_057800939.1`	Pfam	`PF01490`	Aa_trans	Domain	29	425	1.8e-48	166.0	Transmembrane amino acid transporter protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944956.1
AATACTACCAATAGACAAATCTAGAGTAGAGTTACTTATAATTAAACGGACAAGGAAGGAGGACCACTTTCCAACTCATCCACAAAATTAACGAAAAAAGTAAGCAGAAAAATCCTGCATCATGGCTCCGACGATTGAGGCCGGCGGAGCAGAGGCCCCTCTCCTCCCTAACCACCACGACGACAGCTCGAAGAAGCGGCCATCGCTGCCGGGGGCCGTCTTCAACGTGGCGACGAGCATAATCGGCGCCGGGATCATGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016294
ATGGCTCCGACGATTGAGGCCGGCGGAGCAGAGGCCCCTCTCCTCCCTAACCACCACGACGACAGCTCGAAGAAGCGGCCATCGCTGCCGGGGGCCGTCTTCAACGTGGCGACGAGCATAATCGGCGCCGGGATCATGTCCATTCCAGCCACTCTCAAAGTCCTCGGAGTTATTCCAGCCTTCTTGATGATCGTTTTGATAGGTGTATTGGTGGAAATATCTGTGGAGTTCATGCTCAGGTTTACATACTCCGGCGAGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800939.1
MAPTIEAGGAEAPLLPNHHDDSSKKRPSLPGAVFNVATSIIGAGIMSIPATLKVLGVIPAFLMIVLIGVLVEISVEFMLRFTYSGEARTYAGLMKESFGRWGAVAVQICVMITNLGCLIMYLIIIGDVLSGTGADHLGVLQEWCGVHWWNTRAVALLFITVFVMLPLLLYRRVESLWLSSAISVLLAVVFVGICTAMAVAALIQGETKTPKFLPDLDGGASFFNLFTAVPVIVTAFTFHFNVHAIGVELGKASDMMSAVR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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