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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003197`

染色体: Chr03 坐标: 49480888-49490223 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003197`
名称	SmilChr03G003197
描述	protein transport protein SEC24 A-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	49480888 - 49490223 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016307`
GeneID	`131016307`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016307`
原始查询	`LOC131016307`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein transport protein SEC24 A-like
产物	protein transport protein SEC24 A-like
Arabidopsis	`AT3G07100` (ERMO2) Sec23/Sec24 protein transport family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819896] identity=64.5; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0129500` - identity=69.5; qcov=0.733; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000149 (SNARE binding); GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0006888 (endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0030127 (COPII vesicle coat); GO:0070971 (endoplasmic reticulum exit site); GO:0090110 (COPII-coated vesicle cargo loading)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00626 (Gelsolin); PF04810 (zf-Sec23_Sec24); PF04811 (Sec23_trunk); PF04815 (Sec23_helical); PF08033 (Sec23_BS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016307

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	1.00000	`XP_057800964.1`
2	Vesicle	囊泡	0.80000	`XP_057800964.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057800964.1`
4	Endosome	内体	0.40000	`XP_057800964.1`
5	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.20000	`XP_057800964.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:49481595`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr3:49482504`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr3:49482571`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr3:49482803`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B54,B86,C59
`Chr3:49483223`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr3:49483731`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:49484688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr3:49486009`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,D9
`Chr3:49487127`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B88,C45,C73
`Chr3:49487233`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr3:49487424`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr3:49487457`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,B75,C33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800964.1

1072 aa

536

1072

zf-Sec23_Sec24

Sec23_trunk

Sec23_BS

Sec23_helical

Gelsolin

PF04810 zf-Sec23_Sec24 406-444 aa PF04811 Sec23_trunk 481-717 aa PF08033 Sec23_BS 723-807 aa PF04815 Sec23_helical 818-921 aa PF00626 Gelsolin 945-994 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800964.1`	Pfam	`PF04810`	zf-Sec23_Sec24	Domain	406	444	2.1e-18	66.8	Sec23/Sec24 zinc finger
`XP_057800964.1`	Pfam	`PF04811`	Sec23_trunk	Domain	481	717	3.5e-86	289.5	Sec23/Sec24 trunk domain
`XP_057800964.1`	Pfam	`PF08033`	Sec23_BS	Domain	723	807	2.2e-26	92.9	Sec23/Sec24 beta-sandwich domain
`XP_057800964.1`	Pfam	`PF04815`	Sec23_helical	Domain	818	921	2.1e-25	89.2	Sec23/Sec24 helical domain
`XP_057800964.1`	Pfam	`PF00626`	Gelsolin	Domain	945	994	1.9e-05	25.1	Gelsolin repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944981.1
TTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTACTGCGTCTTCACTTAAAAGAGCGAAAGTAATCGGACTCTCTTTTCGTTGTGTTTTCCTCTCTATCTTCTCTCTCTGATCGCCGGCTCTCGATTCTTCTATCGCGCTCTCTGCCGGCGAGATCTCCGATTAGAAATTCAGCCATTTCCTTAGTGATCAAGCTAAATCTTTATGGGGACCGAAAATCCTAATCGTCCAAACTATCCATTAAGACCAGCTGCAACACCCTTTGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016307
ATGGGGACCGAAAATCCTAATCGTCCAAACTATCCATTAAGACCAGCTGCAACACCCTTTGCTTCTCATCAATCTTCAACACCTTTCTTGTCGTCTGGTCCTGTTGTTGGATCAGAAGCACCTGTCTTTAGGCCTGGACCTCCTGCGGCCTCGAATTTTCAAGCACCTCCCTTTTCTGGAGGACCTTTGGTTGGAACGGAGGCCCCTGCCTTTAGACCCCCTCCAAGTAGATCTAATGAAGTGGTCCGCCCACCTCCTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800964.1
MGTENPNRPNYPLRPAATPFASHQSSTPFLSSGPVVGSEAPVFRPGPPAASNFQAPPFSGGPLVGTEAPAFRPPPSRSNEVVRPPPPPSSYGPPTSGFQSFPNPPVPSAGKVLPPHISLTGQPAIAPPTRPPPGSASLLSQPQPPLVSMGSPPQSIKTGQPNPNIPPPAAQHFSAPRPSSQPSSPPTGTSYAAGRGTYPGYANMQPNSAPQAPTMQPASFQSQQGGYGPPMQPASFQSQQGGYGPPVQSASFPLQQGGYA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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