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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003192`

染色体: Chr03 坐标: 49377779-49390601 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003192`
名称	SmilChr03G003192
描述	lysine-specific demethylase JMJ31
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	49377779 - 49390601 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016316`
GeneID	`131016316`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016316`
原始查询	`LOC131016316`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	lysine-specific demethylase JMJ31
产物	lysine-specific demethylase JMJ31
Arabidopsis	`AT5G19840` (AT5G19840) 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832104] identity=51.5; qcov=0.896; evalue=1.54e-145; confidence=high
Rice	`Os09g0489200` (JMJ712) - identity=34.5; qcov=0.32; evalue=2.53e-18; confidence=low
GO	GO:0016706 (2-oxoglutarate-dependent dioxygenase activity)
KEGG	-
Pfam	PF13621 (Cupin_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016316

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057800980.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057800980.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057800980.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800980.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800980.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:49381405`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr3:49384805`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr3:49384969`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:49385713`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr3:49386761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr3:49389567`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr3:49390444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B88,C45,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800980.1

539 aa

270

539

Cupin_8

PF13621 Cupin_8 15-290 aa

XP_057800981.1

453 aa

226

453

Cupin_8

PF13621 Cupin_8 72-204 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800980.1`	Pfam	`PF13621`	Cupin_8	Domain	15	290	1.2e-52	180.0	Cupin-like domain
`XP_057800981.1`	Pfam	`PF13621`	Cupin_8	Domain	72	204	6.4e-48	164.6	Cupin-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XR_009098917.1
GGGTTTAGTATTTGAGCAAAAGCTACAAACATTCATTACTCTGCGCTACAGCTACAGCCTACAGGCAGCAGAAATGGAGTCTCTGCAGATACGCCGACTTGATGAAATTCCGTCGCCGGAAGAATTCGCCTCTCAGATTGAACAGAAGAATGTCCCCGCAGTCTTCAGTGGATGCGCGAAGGAGTGGAAAGCATTTTCGAAATGGAATGTATCGAATGGCGGTCTCGACTACTTGCAGGAATTAGTGGGATCGTCGGTTG...

XR_009098918.1
GGGTTTAGTATTTGAGCAAAAGCTACAAACATTCATTACTCTGCGCTACAGCTACAGCCTACAGGCAGCAGAAATGGAGTCTCTGCAGATACGCCGACTTGATGAAATTCCGTCGCCGGAAGAATTCGCCTCTCAGATTGAACAGAAGAATGTCCCCGCAGTCTTCAGTGGATGCGCGAAGGAGTGGAAAGCATTTTCGAAATGGAATGTATCGAATGGCGGTCTCGACTACTTGCAGGAATTAGTGGGATCGTCGGTTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016316
ATGGAGTCTCTGCAGATACGCCGACTTGATGAAATTCCGTCGCCGGAAGAATTCGCCTCTCAGATTGAACAGAAGAATGTCCCCGCAGTCTTCAGTGGATGCGCGAAGGAGTGGAAAGCATTTTCGAAATGGAATGTATCGAATGGCGGTCTCGACTACTTGCAGGTTTCCATTGTAAATACTGAAAATGAGGAAAAGAGTCAGTTGGAATGCCTTAGAGATGACATTGAAACGCCTGCATTTCTGGACAGCAAAACTCT...

LOC131016316
ATGGAGTCTCTGCAGATACGCCGACTTGATGAAATTCCGTCGCCGGAAGAATTCGCCTCTCAGATTGAACAGAAGAATGTCCCCGCAGTCTTCAGTGGATGCGCGAAGGAGTGGAAAGCATTTTCGAAATGGAATGTATCGAATGGCGGTCTCGACTACTTGCAGGAATTAGTGGGATCGTCGGTTGTGGAAGCTATGCTATCCAGATCTGCACCTGTATTTTATGGAGATATTCGAGGTCATGAAAGGGTTCCTTTGCC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057800980.1
MESLQIRRLDEIPSPEEFASQIEQKNVPAVFSGCAKEWKAFSKWNVSNGGLDYLQELVGSSVVEAMLSRSAPVFYGDIRGHERVPLPFSTFIGYCKDLLQCEDDCQDSISQLRKHEPTGDATQQVDFAMGEESPKQIYLAQVSIVNTENEEKSQLECLRDDIETPAFLDSKTLASVNLWMNNAKSRSSTHYDPHHNLLCIISGCKQVVLWPPSASPFLYPLPVYGESSNHSAIPLENTNFSLYPRAKSIDKYSRKVTLHA...

XP_057800981.1
MESLQIRRLDEIPSPEEFASQIEQKNVPAVFSGCAKEWKAFSKWNVSNGGLDYLQVSIVNTENEEKSQLECLRDDIETPAFLDSKTLASVNLWMNNAKSRSSTHYDPHHNLLCIISGCKQVVLWPPSASPFLYPLPVYGESSNHSAIPLENTNFSLYPRAKSIDKYSRKVTLHAGDALFIPEGWFHQVDSEDLTIAVNFWWQSDMMSSMPEHMDAYYLRRILKRLTDKEMDRMLSMPSTSKVNHMIGASGQSSNVNAGCC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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