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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003179`

染色体: Chr03 坐标: 49251104-49254743 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003179`
名称	SmilChr03G003179
描述	VAN3-binding protein
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	49251104 - 49254743 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016319`
GeneID	`131016319`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016319`
原始查询	`LOC131016319`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	VAN3-binding protein
产物	VAN3-binding protein
Arabidopsis	`AT3G22810` (AT3G22810) auxin canalization protein (DUF828) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821852] identity=61.5; qcov=0.967; evalue=6.27e-177; confidence=high
Rice	`Os12g0604200` - identity=60.1; qcov=0.681; evalue=2.63e-76; confidence=high
GO	GO:0009734 (auxin-activated signaling pathway); GO:0010087 (phloem or xylem histogenesis); GO:0010305 (leaf vascular tissue pattern formation)
KEGG	-
Pfam	PF05703 (Auxin_canalis); PF08458 (PH_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016319

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057800984.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057800984.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800984.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800984.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800984.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:49251379`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr3:49251392`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr3:49253238`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr3:49253409`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr3:49253421`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:49253430`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C21,D10
`Chr3:49253582`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,C28,C74
`Chr3:49253586`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B50,B60
`Chr3:49253779`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr3:49253866`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr3:49253878`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B31,C82,D6
`Chr3:49253974`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B31,C82,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800984.1

486 aa

243

486

Auxin_canalis

PH_2

PF05703 Auxin_canalis 24-322 aa PF08458 PH_2 372-477 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800984.1`	Pfam	`PF05703`	Auxin_canalis	Family	24	322	7e-107	358.0	Auxin canalisation
`XP_057800984.1`	Pfam	`PF08458`	PH_2	Domain	372	477	5.6e-42	143.1	Plant pleckstrin homology-like region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945001.1
ACACAGTATTCATGCAAGTAAATTCCATTTGGAAAAGCAAAGCAAAGCAAAAAACCATTCCCGCCATCATATCCTTTCTCTCACATCATGTACAACACGAGTACGAAGATGGACATTCTGTGGGCCGAGAAGGGCCCGAACGGCGAGCTTCCGCTGCCGGAAAGCCCGAGAGGGCCCATGGAGTTTCTGTCGCGGTCGTGGAGCGCCTCCGCCCTTCAACTATCTAAAGCCCTCACTCCTACTTCCAATACCTCCGCAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016319
ATGTACAACACGAGTACGAAGATGGACATTCTGTGGGCCGAGAAGGGCCCGAACGGCGAGCTTCCGCTGCCGGAAAGCCCGAGAGGGCCCATGGAGTTTCTGTCGCGGTCGTGGAGCGCCTCCGCCCTTCAACTATCTAAAGCCCTCACTCCTACTTCCAATACCTCCGCAATGCTCGTCAAGACCGCCGTACCTCACGCCGCCGCCGCCATACCCGAAAACAACGCCGCCGAAGAAGAGGAGAGCGCTAAGCTTTCAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800984.1
MYNTSTKMDILWAEKGPNGELPLPESPRGPMEFLSRSWSASALQLSKALTPTSNTSAMLVKTAVPHAAAAIPENNAAEEEESAKLSGNTFSFASTATSQLILERIMSQSEISPLTSGRLSHSSGPLNCLTEETESPPISPSDEYEDVVKYLRANNTLQPLFTGTPRAGFAAAAAVGGANTPGGKTVGRWLKERREKKKEETRTHNAQLHAAVSVAGVAAAIAAIAAATAASSSNCKDEQMAKTDMAVASAATLVAAQCVE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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