当前解析结果
SmilChr03G003189| 统一新 Gene ID | SmilChr03G003189 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G003189 |
| 描述 | heat stress transcription factor A-7a-like |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 49354509 - 49356288 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131016328 |
|---|---|
| GeneID | 131016328 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131016328 |
| 原始查询 | LOC131016328 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | heat stress transcription factor A-7a-like |
| 产物 | heat stress transcription factor A-7a-like |
| Arabidopsis | AT3G22830 (HSFA6B)heat shock transcription factor A6B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821854] identity=47.2; qcov=1.17; evalue=3.03e-65; confidence=high |
| Rice | Os07g0178600 (HSFA2B)- identity=47.5; qcov=1.06; evalue=4.43e-66; confidence=high |
| GO | GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00447 (HSF_DNA-bind) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131016328 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057800997.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057800997.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057800997.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057800997.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057800997.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057800997.1PF00447
HSF_DNA-bind 38-127 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057800997.1 |
Pfam | PF00447 |
HSF_DNA-bind | Domain | 38 | 127 | 5.2e-31 | 107.9 | HSF-type DNA-binding |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。