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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003163`

染色体: Chr03 坐标: 49012268-49013072 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003163`
名称	SmilChr03G003163
描述	CST complex subunit STN1
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	49012268 - 49013072 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016338`
GeneID	`131016338`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016338`
原始查询	`LOC131016338`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CST complex subunit STN1
产物	CST complex subunit STN1
Arabidopsis	`AT1G07130` (STN1) Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837223] identity=51; qcov=0.91; evalue=1.04e-51; confidence=high
Rice	`Os03g0366900` - identity=50; qcov=0.916; evalue=1e-41; confidence=medium
GO	GO:0000724 (double-strand break repair via homologous recombination); GO:0000781 (chromosome, telomeric region); GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0005662 (DNA replication factor A complex); GO:0006260 (DNA replication); GO:0006289 (nucleotide-excision repair); GO:0035861 (site of double-strand break)
KEGG	-
Pfam	PF01336 (tRNA_anti-codon)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016338

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057801013.1`
2	Chromosome	染色体	0.60000	`XP_057801013.1`
3	Telomere	端粒	0.40000	`XP_057801013.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801013.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801013.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:49012713`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr3:49012817`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C28
`Chr3:49012817`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C28
`Chr3:49012827`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,B60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801013.1

166 aa

166

tRNA_anti-codon

PF01336 tRNA_anti-codon 48-134 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801013.1`	Pfam	`PF01336`	tRNA_anti-codon	Domain	48	134	9.6e-08	32.6	OB-fold nucleic acid binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945030.1
TATATATCTCATAATAATATATAGATATATTTTTAAATATCATTATATGAATAAAACTCCAAAACGAAAAACAAAAATATTGCAATTTCCGAACATTACATCAAAAAAGAAAAAGCGATTTATTTGAGTGATTTAAATTCCCGCGTAAATGTTTGGGTGTGCAGCCATGGATTTGTACAACACTCACGTCAAGCTTTTAGCTTTCGATTTTGTGTCTCTCACGCCCAACCGAGCAGACTCATCGACCTTCCTCCGCAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016338
ATGTTTGGGTGTGCAGCCATGGATTTGTACAACACTCACGTCAAGCTTTTAGCTTTCGATTTTGTGTCTCTCACGCCCAACCGAGCAGACTCATCGACCTTCCTCCGCAAAGGGCTGCGCCTATCGCGCGCCGAGACGATCGGAGTGGTCGTGACTCGGGATCTCAAGCCCGGCAAATTCCTCCGTTTCTCCATCGACGATGGCACCGGCTGCATCCCCTGTGTGCTCTGGCTCAACCAACTCACCTCGCCTTACTTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801013.1
MFGCAAMDLYNTHVKLLAFDFVSLTPNRADSSTFLRKGLRLSRAETIGVVVTRDLKPGKFLRFSIDDGTGCIPCVLWLNQLTSPYFSRRSPSAVRSIAQTALKFASDIQLGVVARVRGRITGFRGALQITVADVALETDPNAQVLHWLDCVRLARRCYDKFSRIAV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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