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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003205`

染色体: Chr03 坐标: 49589777-49591936 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003205`
名称	SmilChr03G003205
描述	probable xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 26
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	49589777 - 49591936 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016350`
GeneID	`131016350`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016350`
原始查询	`LOC131016350`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 26
产物	probable xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 26
Arabidopsis	`AT4G28850` (XTH26) xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase 26 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829006] identity=47.6; qcov=1.02; evalue=1.45e-98; confidence=high
Rice	`Os06g0696400` (OsXTH11) - identity=43.3; qcov=1; evalue=2.63e-84; confidence=medium
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005618 (cell wall); GO:0010411 (xyloglucan metabolic process); GO:0016762 (xyloglucan:xyloglucosyl transferase activity); GO:0042546 (cell wall biogenesis); GO:0048046 (apoplast)
KEGG	-
Pfam	PF00722 (Glyco_hydro_16); PF06955 (XET_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016350

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057801030.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057801030.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057801030.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801030.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801030.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:49589991`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B120,B44,B98,D6
`Chr3:49590076`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B59,C61,C83
`Chr3:49590101`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B38,B39,B5,C65,C79
`Chr3:49590835`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C55,D8
`Chr3:49591514`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B129,B137,C33,C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801030.1

293 aa

146

293

Glyco_hydro_16

XET_C

PF00722 Glyco_hydro_16 51-215 aa PF06955 XET_C 250-288 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801030.1`	Pfam	`PF00722`	Glyco_hydro_16	Domain	51	215	6.1e-56	189.4	Glycosyl hydrolases family 16
`XP_057801030.1`	Pfam	`PF06955`	XET_C	Family	250	288	3.6e-10	40.2	Xyloglucan endo-transglycosylase (XET) C-terminus

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945047.1
AGTATCTGTTAATTGTTGCCAGTCATTATGATCGTACACTTTATTAATATTCTTTAGAGAGAGGGAGAGATAAAATAAGAGTATGATTGAGACAGAGATGTAGCCGCTATCATCATATTCATATAACATTAATAATGAGTCTTCCTTTTGTCTCTGTGATTGAGGCGGTGTCTGCTGCTTTAATTGTGTGAATTTAATTATAAATGTGAGTGCGTGTGTGTATCGCAAGTCGATTGTATTATTTGTAGATTAGGGTGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016350
ATGGGTGGAAAAATGGCGGATTTAGAGTTTGTGATAGCAATGGCAATCATATTTGGTGCATTGAATTCAAATTTGATTGAAGGAAGAAGTATGTTGAAGAGCATGCATTTGAGCTGGGGCACTCAGCGTTCTGGCTTTCTCCAGCCTGCCGGTAGAGATGATGTTACTCTCGTTCTCGACCCTGTCTCAGGTTCTGGAATCCAATCGAAGGATCAATTTTTGTTTGGAACGGTTGAGATGCAAATGAAGCTTGTACCCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801030.1
MGGKMADLEFVIAMAIIFGALNSNLIEGRSMLKSMHLSWGTQRSGFLQPAGRDDVTLVLDPVSGSGIQSKDQFLFGTVEMQMKLVPGDSAGTVTSFYLSSLGAKHNEIDFEFLGNVSGQPYIIHTNIYTQGAAGREVQFYPWFDPSKDYHNYTIHWTPSHVVWLVDKIPIRVYKNYLEDGIPYPDLQQPMRAYSSIWNADSWATRGGLDRINWSKAPFIAKLRKFRARACRFQGTTSVAQCSAAAAPSTTSQLTLDAQNQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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