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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003209`

染色体: Chr03 坐标: 49681917-49685813 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003209`
名称	SmilChr03G003209
描述	beta-carotene isomerase D27, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	49681917 - 49685813 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016354`
GeneID	`131016354`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016354`
原始查询	`LOC131016354`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	beta-carotene isomerase D27, chloroplastic
产物	beta-carotene isomerase D27%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G03055` (D27) beta-carotene isomerase D27-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838334] identity=55.3; qcov=0.65; evalue=3.55e-75; confidence=high
Rice	`Os11g0587000` (D27) - identity=53.8; qcov=0.792; evalue=9.62e-89; confidence=high
GO	GO:0005506 (iron ion binding)
KEGG	smil00906 (Carotenoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF13225 (D27-like_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016354

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057801034.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057801034.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.40000	`XP_057801034.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801034.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801034.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:49682238`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B18,B47,B85,C18,C2
`Chr3:49683664`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,C71
`Chr3:49685439`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr3:49685443`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr3:49685455`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr3:49685639`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	64	A1,A18,A19,A22,A24,A25,A8,B101,B103,B114,B115,B119,B127,B128,B13,B131,B136,B20,B38,B39,B40,B49,B52,B53,B65,B69,B73,B74,B75,B79,B8,B80,B84,B87,B91,B93,B99,C15,C19,C25,C3,C31,C34,C37,C41,C44,C49,C51,C53,C57,C58,C60,C63,C64,C66,C67,C69,C78,C8,C82,C83,C85,C9,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801034.1

303 aa

152

303

D27-like_C

PF13225 D27-like_C 198-278 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801034.1`	Pfam	`PF13225`	D27-like_C	Domain	198	278	2.2e-33	114.8	Beta-carotene isomerase D27-like, C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945051.1
TCTTGCAAGCTGAACTGATTAAAATAACAAAAGAAAACAAATGCAACACATATTTAGAAAAATAGTAACAAGATCCACAGTGTTGAGAGTTAAGATTCGGCAATGCCTTCCGCTTAAATATACCATCTCTTCTGTTTTTGTTCTTTTCCATCATCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGATGGAAGCAACGTCGTCTCTGGCGCAGCCGTGCAGGAGCCTCTTTCCGCCTCCGCGATTCAACCGGCGGATCGCCATGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016354
ATGCAACACATATTTAGAAAAATAGTAACAAGATCCACAGTGTTGAGAGTTAAGATTCGGCAATGCCTTCCGCTTAAATATACCATCTCTTCTGTTTTTGTTCTTTTCCATCATCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGATGGAAGCAACGTCGTCTCTGGCGCAGCCGTGCAGGAGCCTCTTTCCGCCTCCGCGATTCAACCGGCGGATCGCCATGCACAACCCTAGACGGTCCAATTTCAGTCGATCAGTAGCCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801034.1
MQHIFRKIVTRSTVLRVKIRQCLPLKYTISSVFVLFHHRSLSLSLSLMEATSSLAQPCRSLFPPPRFNRRIAMHNPRRSNFSRSVATDHNLDASSAHDSETKTSYADNWFDRLAINHLSQSLQSSAGMSSSKGGYEGLVEAATMASRKFDPIQQRRVVIQTLQTAFPAPILFLIKKMLPPSKFAREYFAIFTTIFFAWLVGPCQVKESEFQGRREKNVVYVPKCRFLEETNCVGMCTNLCKMPSQSFIKDSLGISINMVP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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