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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000330`

染色体: Chr01 坐标: 6741117-6743621 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000330`
名称	SmilChr01G000330
描述	F-box protein At2g32560-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	6741117 - 6743621 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016356`
GeneID	`131016356`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016356`
原始查询	`LOC131016356`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein At2g32560-like
产物	F-box protein At2g32560-like
Arabidopsis	`AT2G26850` (AT2G26850) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817226] identity=52.2; qcov=1.02; evalue=1.35e-108; confidence=high
Rice	`Os01g0281000` (OsFbox006) - identity=54.2; qcov=0.91; evalue=1.38e-95; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016356

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057801039.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801039.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801039.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801039.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057801039.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:6742004`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr1:6742230`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B81,D11
`Chr1:6743145`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,B55
`Chr1:6743239`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B32
`Chr1:6743239`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B32
`Chr1:6743271`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B56,B96
`Chr1:6743271`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr1:6743274`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B56,B96
`Chr1:6743274`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B56,B96

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801039.1

319 aa

160

319

F-box

F-box-like

PF00646 F-box 19-60 aa PF12937 F-box-like 19-61 aa

XP_057801042.1

288 aa

144

288

F-box

F-box-like

PF00646 F-box 19-60 aa PF12937 F-box-like 19-61 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801039.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	19	60	7.7e-08	32.7	F-box domain
`XP_057801039.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	19	61	8.7e-08	32.5	F-box-like
`XP_057801042.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	19	60	6.7e-08	32.9	F-box domain
`XP_057801042.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	19	61	9.9e-08	32.4	F-box-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945056.1
GAATTTGAATTATTGAGTTATTTATAATTTGGTTGAATTTTCGTATTTCAAAAAACCCTTTTCCTGATCTCCCACAAAGCTCAAGTTTTTAACTTGTGCATATTGACTGCTCTCATCCTTTTCCTTTCTATTATTGGTCGCCTTCGCTCTTTTACACAACACACAGAGATACGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTTCTTGTATTTATATATAAGTATTAGTTGGGCCTCTGTTGTGAAATGCTACTTT...

XM_057945059.1
GAATTATTGAGTTATTTATAATTTGGTTGAATTTTCGTATTTCAAAAAACCCTTTTCCTGATCTCCCACAAAGCTCAAGTTTTTAACTTGTGCATATTGACTGCTCTCATCCTTTTCCTTTCTATTATTGGTCGCCTTCGCTCTTTTACACAACACACAGAGATACGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTTCTTGTATTTATATATAAGTATTAGTTGGGCCTCTGTTGTGAAATGCTACTTTTCTTCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016356
ATGTCACCAAAAACGAAGGTCTCCGCCGCCTTGCCGGCGCCGGAGATGTCGGTGCTGGACCTGCCGGAGCTGGTGCTGGAATGCATCCTGGAGAAGCTCCCGGCGGAGGGGCTGTGCCGAATGGCGAGCGTCTGCACTTCCCTCAGAGACGGCTGCGGGAGCGATCATCTATGGCGGAAGCATATGGAGAGCAAATGGGGGCGAATCATCGGCGCTGCTGCAAACAGTGAATGGGAGTGCTACATCGCTTCAAGAAAAGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057801039.1
MSPKTKVSAALPAPEMSVLDLPELVLECILEKLPAEGLCRMASVCTSLRDGCGSDHLWRKHMESKWGRIIGAAANSEWECYIASRKGLNQAKHKGLMGYLLALIRSAWSGGAGRRTTSSAVDSVMSKYLALESGDFWFPAQVYNRENGHVGFMLSCYDAMVSYDRRSESFNARYPAHGARASATESGVTWERLRAPLVPTSPHHLHISDCLHDLHPGHHIEIQWRRNKDFPYGWWYGVVGHLETCDGNANYCRCHNSETV...

XP_057801042.1
MSPKTKVSAALPAPEMSVLDLPELVLECILEKLPAEGLCRMASVCTSLRDGCGSDHLWRKHMESKWGRIIGAAANSEWECYIASRKGLNQAKHKGLMGYLLALIRSAWSGGAGRRTTSSAVDSVMSKYLALESGDFWFPAQVYNRENGHVGFMLSCYDAMVSYDRRSESFNARYPAHGARASATESGVTWERLRAPLVPTSPHHLHISDCLHDLHPGHHIEIQWRRNKDFPYGWWYGVVGHLETCDGNANYCRCHNSAMV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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