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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003235`

染色体: Chr03 坐标: 50257257-50259154 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003235`
名称	SmilChr03G003235
描述	40S ribosomal protein S21-2-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	50257257 - 50259154 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016376`
GeneID	`131016376`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016376`
原始查询	`LOC131016376`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	40S ribosomal protein S21-2-like
产物	40S ribosomal protein S21-2-like
Arabidopsis	`AT5G27700` (AT5G27700) Ribosomal protein S21e [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832832] identity=84; qcov=0.988; evalue=1.65e-49; confidence=medium
Rice	`Os03g0345200` (RPS21) - identity=81.7; qcov=1; evalue=1.19e-48; confidence=medium
GO	GO:0000447 (endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)); GO:0000461 (endonucleolytic cleavage to generate mature 3'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022627 (cytosolic small ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01249 (Ribosomal_S21e)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016376

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057801046.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057801046.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801046.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801046.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801046.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:50258157`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801046.1

82 aa

Ribosomal_S21e

PF01249 Ribosomal_S21e 1-77 aa

XP_057801047.1

82 aa

Ribosomal_S21e

PF01249 Ribosomal_S21e 1-77 aa

XP_057801048.1

82 aa

Ribosomal_S21e

PF01249 Ribosomal_S21e 1-77 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801046.1`	Pfam	`PF01249`	Ribosomal_S21e	Family	1	77	3.3e-40	136.8	Ribosomal protein S21e
`XP_057801047.1`	Pfam	`PF01249`	Ribosomal_S21e	Family	1	77	3.3e-40	136.8	Ribosomal protein S21e
`XP_057801048.1`	Pfam	`PF01249`	Ribosomal_S21e	Family	1	77	3.3e-40	136.8	Ribosomal protein S21e

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945064.1
GTGGGTCGGATATCAGATCCGGATAAACCCGGATTATACCGTATAAACTGTAAAGAGGATTTAGGGTTTTTGGCAGCTTCGAATATAAAACAGACATTACAGAAAAGCCGCCCCAAGGTTGCTCTTCTGCATTTTCCTATCTCGGTGATTTGAGATTAATTGGATTGCATTGAGTTTGGAAGACTCAGCCAAGATGCAGAATGAGGAGGGGCAAAACATGGATCTTTATATTCCCAGGAAGTGCTCTGCCACCAACAGAC...

XM_057945065.1
TTGGCAGCTTCGAATATAAAACAGACATTACAGAAAAGCCGCCCCAAGGTGATTTGAGATTAATTGGATTGCATTGAGTTTGGAAGACTCAGCCAAGATGCAGAATGAGGAGGGGCAAAACATGGATCTTTATATTCCCAGGAAGTGCTCTGCCACCAACAGACTGATCACTTCCAAGGATCACGCATCTGTCCAGATCAACATTGGGCATGTGGATGAGAGTGGCAGATACACTGGGCAATTCTCAACCTTTGCTCTTT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131016376
ATGCAGAATGAGGAGGGGCAAAACATGGATCTTTATATTCCCAGGAAGTGCTCTGCCACCAACAGACTGATCACTTCCAAGGATCACGCATCTGTCCAGATCAACATTGGGCATGTGGATGAGAGTGGCAGATACACTGGGCAATTCTCAACCTTTGCTCTTTGTGGATTCATTCGCGCCCAGGGCGACGCTGACAGTGCACTCGATAGGCTCTGGCAGAAAAAGAAAGTTGAAGCCCAACAACAGTAA

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057801046.1
MQNEEGQNMDLYIPRKCSATNRLITSKDHASVQINIGHVDESGRYTGQFSTFALCGFIRAQGDADSALDRLWQKKKVEAQQQ

XP_057801047.1
MQNEEGQNMDLYIPRKCSATNRLITSKDHASVQINIGHVDESGRYTGQFSTFALCGFIRAQGDADSALDRLWQKKKVEAQQQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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