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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000325`

染色体: Chr01 坐标: 6539656-6559465 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000325`
名称	SmilChr01G000325
描述	protein-lysine N-methyltransferase EFM3
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	6539656 - 6559465 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016383`
GeneID	`131016383`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016383`
原始查询	`LOC131016383`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein-lysine N-methyltransferase EFM3
产物	protein-lysine N-methyltransferase EFM3
Arabidopsis	`AT2G26810` (AT2G26810) Putative methyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817222] identity=68; qcov=0.974; evalue=6.62e-112; confidence=high
Rice	`Os07g0641600` (P0524G08.115) - identity=60.5; qcov=0.974; evalue=1.54e-102; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0006479 (protein methylation); GO:0008276 (protein methyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF10294 (Methyltransf_16)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016383

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057801061.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057801061.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057801061.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801061.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801061.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:6557444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr1:6557508`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C49,C71
`Chr1:6557526`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr1:6559109`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B3,C24,C46
`Chr1:6559229`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B3,C24,C46
`Chr1:6559257`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801061.1

234 aa

117

234

Methyltransf_16

PF10294 Methyltransf_16 49-193 aa

XP_057801071.1

234 aa

117

234

Methyltransf_16

PF10294 Methyltransf_16 49-193 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801061.1`	Pfam	`PF10294`	Methyltransf_16	Family	49	193	5.1e-22	79.2	Lysine methyltransferase
`XP_057801071.1`	Pfam	`PF10294`	Methyltransf_16	Family	49	193	5.1e-22	79.2	Lysine methyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945088.1
GATTAACTATTCTTGTGCGGCCCTAATTTCAGTTCACATAACAAAAATACAGAATAGAAGAAGAACAACACTATCTCCTAATTTCAGTTCACAGCTGCCAAGCCACGGTAGCCCTCATCGCGCCTCCAGTCGCTAACAGCCTTCGTTGCGCCCCCACCCGACACCAGCAGCTTCACCTCGCTGCTCCTCCTTCCCACCGCAACGCGCATCCGGTCGTTTCGCCGCTAGTCAGCATCCCTCCGGCCACTACGTCCGTTTGA...

XM_057945078.1
CTTATAAAAAGCATCAACTAGCCCTAATATTTTGTGATCCCTTAAACCTTGTCAACAGCAGTCTTGCTAACTGTAAATTGTATACTAGAAAATCAGCAAGTGTCGAGAAAGAGAGATGGAAAGTGTCGAAGAGAACGATATCGTTTGCTTGGATGAATCTTTCTTCATCAACGACAACTACCAACTCACGAGGTTTACATTTGGGTCGCAAGTTCTTGAACTCTATTGCCTCCAGTCCGCTTCAACTGATTTTGATTTGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016383
ATGGAAAGTGTCGAAGAGAACGATATCGTTTGCTTGGATGAATCTTTCTTCATCAACGACAACTACCAACTCACGAGGTTTACATTTGGGTCGCAAGTTCTTGAACTCTATTGCCTCCAGTCCGCTTCAACTGATTTTGATTTGACAGGGCAGATGGTATGGCCGGGAGCAGAGCTCTTGAATGATTATCTCTCGAAGAACTCTGACATTCTGCAAGGGTGTTCGGTTATTGAGCTTGGCTCTGGTGTCGGCGTTACCGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057801061.1
MESVEENDIVCLDESFFINDNYQLTRFTFGSQVLELYCLQSASTDFDLTGQMVWPGAELLNDYLSKNSDILQGCSVIELGSGVGVTGILCSRFCREVVMTDHNDEVLKILTRNIVLDDSSKNTICSAEKLEWGNSEQLNDILQRHPDGFDLVLGADICFQQANVPLLFRTVKQLLHVGLKKKCRFILAYVSRAKVMDDMVVGEASRHGLRITEVAGTRAEIRNLGGVIYEMTCA

XP_057801071.1
MESVEENDIVCLDESFFINDNYQLTRFTFGSQVLELYCLQSASTDFDLTGQMVWPGAELLNDYLSKNSDILQGCSVIELGSGVGVTGILCSRFCREVVMTDHNDEVLKILTRNIVLDDSSKNTICSAEKLEWGNSEQLNDILQRHPDGFDLVLGADICFQQANVPLLFRTVKQLLHVGLKKKCRFILAYVSRAKVMDDMVVGEASRHGLRITEVAGTRAEIRNLGGVIYEMTCA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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