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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003244`

染色体: Chr03 坐标: 50331753-50334017 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003244`
名称	SmilChr03G003244
描述	GABA transporter 1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	50331753 - 50334017 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016384`
GeneID	`131016384`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016384`
原始查询	`LOC131016384`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GABA transporter 1-like
产物	GABA transporter 1-like
Arabidopsis	`AT1G08230` (AT1G08230) Transmembrane amino acid transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837344] identity=35.4; qcov=0.962; evalue=4.52e-63; confidence=medium
Rice	`Os10g0415100` (OsGAT4) - identity=67.4; qcov=0.965; evalue=5.48e-168; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF01490 (Aa_trans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016384

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057801058.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057801058.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057801058.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801059.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801059.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:50332000`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B79,D4
`Chr3:50332070`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B79,D4
`Chr3:50332158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B79,C51,D4
`Chr3:50332451`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B76,B90,B92
`Chr3:50332540`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	24	A23,A24,A5,A6,B1,B107,B109,B110,B112,B32,B54,B62,B7,C25,C32,C42,C46,C5,C52,C60,C62,C68,C73,C84
`Chr3:50332590`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B28,B49,C39
`Chr3:50332811`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr3:50333021`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr3:50333443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr3:50333765`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B139,B46,B51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801058.1

435 aa

218

435

Aa_trans

PF01490 Aa_trans 18-414 aa

XP_057801059.1

346 aa

173

346

Aa_trans

PF01490 Aa_trans 16-325 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801058.1`	Pfam	`PF01490`	Aa_trans	Domain	18	414	7.3e-70	236.4	Transmembrane amino acid transporter protein
`XP_057801059.1`	Pfam	`PF01490`	Aa_trans	Domain	16	325	2.3e-53	182.1	Transmembrane amino acid transporter protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945075.1
CACTAAATCTTTTTGTCTCAAAGTTGACTTGTCGTAGTAGTCGAGTAAAAAATAGTGTTGGAATTTGTTCTGTACATATGATTCTGAGAAAGCACAAGTGAGCTACTGCTTGTCTTCCTTAATGGCAGAGAACATTGCGAAAGATGAAGCTGCAGAAGAAGTGGAAATATCTAAAGGCAGCTGGGCGCACGCCGCCTTCCACGTTGCCACCACCATCGCCACCCCCGCCGCATACGCTCCGCTCCCCTTCGCCGTCGCAT...

XM_057945076.1
GTCGCATCTCTCGGCTGGCCGCTCGGGGTGAGCAGTTTAGTTGGAGGGACTCTCTGCACATGGTATTCAAGTCTACTCATTGCTTCCCTTTGGAGATGGGATGGCAACAAACACACCACCTATCGACATCTTGCCAAAAGCATTTATGCAGGTGGCTTCTCTTGGAAACAACATTGCCATTCAAATTGCTGCAGGAAGCAGCCTCAAGGCGGTATACAAACACTATGATCCAGATGGTGGCATGACGCTGCAGCATTTCA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016384
ATGGCAGAGAACATTGCGAAAGATGAAGCTGCAGAAGAAGTGGAAATATCTAAAGGCAGCTGGGCGCACGCCGCCTTCCACGTTGCCACCACCATCGCCACCCCCGCCGCATACGCTCCGCTCCCCTTCGCCGTCGCATCTCTCGGCTGGCCGCTCGGGGTGAGCAGTTTAGTTGGAGGGACTCTCTGCACATGGTATTCAAGTCTACTCATTGCTTCCCTTTGGAGATGGGATGGCAACAAACACACCACCTATCGACA...

LOC131016384
ATGGCAACAAACACACCACCTATCGACATCTTGCCAAAAGCATTTATGCAGGTGGCTTCTCTTGGAAACAACATTGCCATTCAAATTGCTGCAGGAAGCAGCCTCAAGGCGGTATACAAACACTATGATCCAGATGGTGGCATGACGCTGCAGCATTTCATCATCTTCTTCGGGGCATTCGAGCTTGCTCTCTCCCAGTTCCCAGACATTCACTCACTCAGATGGCTCAATGCACTCTGCACTCTAAGCACCATTGGCTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057801058.1
MAENIAKDEAAEEVEISKGSWAHAAFHVATTIATPAAYAPLPFAVASLGWPLGVSSLVGGTLCTWYSSLLIASLWRWDGNKHTTYRHLAKSIYGSWGYWSIAFFQQVASLGNNIAIQIAAGSSLKAVYKHYDPDGGMTLQHFIIFFGAFELALSQFPDIHSLRWLNALCTLSTIGFASTVIGVTVYSGKKADRSMITYSLQGSSSDKVFRLFNALGAIAFSFGDAMLPEIQSTVRNPVKTNMYKGISSAYSIIAVTYWQI...

XP_057801059.1
MATNTPPIDILPKAFMQVASLGNNIAIQIAAGSSLKAVYKHYDPDGGMTLQHFIIFFGAFELALSQFPDIHSLRWLNALCTLSTIGFASTVIGVTVYSGKKADRSMITYSLQGSSSDKVFRLFNALGAIAFSFGDAMLPEIQSTVRNPVKTNMYKGISSAYSIIAVTYWQIAFLGFWAFGADVEPYIVASLTTPKWTVVVANLFAVVQILGCFQIYCRPTYAYFEGRVASRKPKAKNSNLRDYLYRLVYTSAYIALITLV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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