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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001828`

染色体: Chr03 坐标: 25027158-25029390 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001828`
名称	SmilChr03G001828
描述	xyloglucan-specific galacturonosyltransferase 1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	25027158 - 25029390 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016388`
GeneID	`131016388`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016388`
原始查询	`LOC131016388`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	xyloglucan-specific galacturonosyltransferase 1-like
产物	xyloglucan-specific galacturonosyltransferase 1-like
Arabidopsis	`AT1G63450` (RHS8) root hair specific 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842651] identity=61.7; qcov=0.771; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0144800` - identity=40.6; qcov=0.821; evalue=3.89e-109; confidence=medium
GO	GO:0006486 (GO:0006486); GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03016 (Exostosin_GT47)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016388

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057801074.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057801074.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801074.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801074.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801074.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:25027728`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B114,C54,C82
`Chr3:25028194`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,B82
`Chr3:25028231`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:25028246`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B49,B87
`Chr3:25028264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr3:25028272`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B69,C14,C38,C71
`Chr3:25028273`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B17,B73,B76,C54
`Chr3:25028479`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B20,B33,C82
`Chr3:25028933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr3:25028973`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr3:25029095`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B114,C12,C54,C82
`Chr3:25029136`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B113

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801074.1

525 aa

262

525

Exostosin_GT47

PF03016 Exostosin_GT47 135-466 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801074.1`	Pfam	`PF03016`	Exostosin_GT47	Domain	135	466	2.3e-76	257.7	Exostosin GT47 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945091.1
ACGTGCTTCCATCGATCAATCGATGTTTCTGGTGAATCCCACACCCTGCACTATTAAAGCAAGAGAAAAAACTCTGTGATTCCATCAATTAATTTATCGAAATGGCTGTTTTAGTGTCCAGGAAGAAGCAGAGGCTGTCTAAGAAATTAGAGGCTGATGAAGTAGGTTTCTTGTGTTTATTTCTTGAAAAGGTTATGCTAAGGGTGCCAGCAGCCTTTTTCATCCTAGCTTTCATCTACATTTGGTCTTCTTCCACCACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016388
ATGGCTGTTTTAGTGTCCAGGAAGAAGCAGAGGCTGTCTAAGAAATTAGAGGCTGATGAAGTAGGTTTCTTGTGTTTATTTCTTGAAAAGGTTATGCTAAGGGTGCCAGCAGCCTTTTTCATCCTAGCTTTCATCTACATTTGGTCTTCTTCCACCACCATTCTTTCCGGCGACATCGTTCATGTCTGCGTATCGTCTAGGAAGCTCAACAATCTCTACTGCCTCTCCGCCGGCACTCAACCCAACTTCAACATCGTCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801074.1
MAVLVSRKKQRLSKKLEADEVGFLCLFLEKVMLRVPAAFFILAFIYIWSSSTTILSGDIVHVCVSSRKLNNLYCLSAGTQPNFNIVQNSTTTADFGSMIPNIENYSAVGNAYEVVEEQLQLHRSWRSSSSNPTTCQGRGIYVYELPSKFNKDLAAQCHDMIPWLDFCTYLSNGGLGEAVEELGSGWYNTHQYALEPIFHARVLNHPCRVHDASEAKLLYVPYYGGLDVLRWHFNNVTNSVKDALSLDLVRWLQTQSSWYK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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