当前解析结果
SmilChr03G002174| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002174 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002174 |
| 描述 | unknown protein 1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 33787753 - 33788917 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131016408 |
|---|---|
| GeneID | 131016408 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131016408 |
| 原始查询 | LOC131016408 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os11g0119900; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os11g0119900; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os11g0119900- identity=31.2; qcov=0.671; evalue=9.66e-11; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131016408 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057801088.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057801088.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057801088.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057801088.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057801088.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:33787959 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B14,B87,C60,C82,D1 |
Chr3:33788345 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B59,B9 |
Chr3:33788465 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C2 |
Chr3:33788475 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B129,C20 |
Chr3:33788502 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B15,C11,C35,C63,C69 |
Chr3:33788556 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B59 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。