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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002177`

染色体: Chr03 坐标: 33826747-33828372 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002177`
名称	SmilChr03G002177
描述	V-type proton ATPase subunit E-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	33826747 - 33828372 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016410`
GeneID	`131016410`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016410`
原始查询	`LOC131016410`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	V-type proton ATPase subunit E-like
产物	V-type proton ATPase subunit E-like
Arabidopsis	`AT4G11150` (TUF) vacuolar ATP synthase subunit E1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826716] identity=71; qcov=1.01; evalue=1.69e-108; confidence=high
Rice	`Os01g0659200` (v-ATP-E) - identity=71.9; qcov=1.01; evalue=2.02e-109; confidence=high
GO	GO:0033178 (proton-transporting two-sector ATPase complex, catalytic domain); GO:0046961 (proton-transporting ATPase activity, rotational mechanism); GO:1902600 (proton transmembrane transport)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04145 (Phagocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01991 (vATP-synt_E)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016410

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057801090.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057801090.1`
3	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.40000	`XP_057801090.1`
4	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	0.20000	`XP_057801090.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801090.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:33827033`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B58,C40
`Chr3:33827173`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr3:33827176`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,C58
`Chr3:33827178`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr3:33827258`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr3:33827581`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr3:33827592`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B115,B123,B46,C3
`Chr3:33827595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,C58
`Chr3:33827667`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,C64,C66
`Chr3:33827672`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B29,B73,C16,C9
`Chr3:33827924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,C64,C66
`Chr3:33828034`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801090.1

226 aa

113

226

vATP-synt_E

PF01991 vATP-synt_E 16-224 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801090.1`	Pfam	`PF01991`	vATP-synt_E	Family	16	224	6.7e-65	219.0	ATP synthase (E/31 kDa) subunit

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945107.1
CTTGATTGTGTTGTAGATTGAATGATTAAAAGAATTGAAAAAGAAGAAAGACAGGAAATATGAATGACGCAGATGTATCGAAGCAGATACAGCAGATGGTGCGGTTCATCCGCCAGGAAGCCCAAGAGAAAGCCAACGAGATTACCCTTTCTGCCGAAGAGGAATGCAATATTGAGAAATTGCAAATAGTTGAGGCTGAGAAGAAGAAAATCAGACAAGAATACGAGCGCAAGAGCAAGCAGGTGGAAGTTCGCAAGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016410
ATGAATGACGCAGATGTATCGAAGCAGATACAGCAGATGGTGCGGTTCATCCGCCAGGAAGCCCAAGAGAAAGCCAACGAGATTACCCTTTCTGCCGAAGAGGAATGCAATATTGAGAAATTGCAAATAGTTGAGGCTGAGAAGAAGAAAATCAGACAAGAATACGAGCGCAAGAGCAAGCAGGTGGAAGTTCGCAAGAAGATTGAGTACTCAATGCAGTTGAACGCATCGCGCATCAAGGTGCTTCAGGCCCAAGACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801090.1
MNDADVSKQIQQMVRFIRQEAQEKANEITLSAEEECNIEKLQIVEAEKKKIRQEYERKSKQVEVRKKIEYSMQLNASRIKVLQAQDDVVNNMKDATRKELQQVATKKGPYKGLLKALIIQSLMRLKEASVLLRCREMDANVVSSVLEEAKREYAKKAGVPVPSVVVDKVYLPPPPTDDIHSIAPSCSGGVVLASRDGKIVCENTLDARLDLVFRQKLPEIRKHLCG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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