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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000341`

染色体: Chr01 坐标: 6957511-6976830 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000341`
名称	SmilChr01G000341
描述	rust resistance kinase Lr10-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	6957511 - 6976830 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016472`
GeneID	`131016472`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016472`
原始查询	`LOC131016472`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rust resistance kinase Lr10-like
产物	rust resistance kinase Lr10-like
Arabidopsis	`AT5G24080` (AT5G24080) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832473] identity=49.8; qcov=0.709; evalue=1.1e-83; confidence=high
Rice	`Os04g0655300` (OsRLCK168) - identity=56.6; qcov=0.739; evalue=3.04e-135; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016472

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057801160.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801160.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801160.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801160.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801160.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:6975257`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B75,C71
`Chr1:6975307`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr1:6975317`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C38
`Chr1:6975317`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C38
`Chr1:6975320`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr1:6975326`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,B72
`Chr1:6975435`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	1	A18
`Chr1:6975435`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	A18
`Chr1:6975521`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,B55
`Chr1:6975625`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr1:6975664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B3,C24,C46
`Chr1:6975784`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801160.1

433 aa

216

433

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 99-368 aa PF00069 Pkinase 100-365 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801160.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	99	368	2.2e-47	162.3	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057801160.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	100	365	4.7e-42	144.9	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945177.1
GTAACAAGAAATTCTATGAGAGAGAGAGAGGGTGGGGGGACACACACTAAGGAGTCACTGCGAAGACCACACTAAGTCAACTGCCATGTACTATCAACATCTTGGTGAAGGATGCATTCCTGCATAATTAAGACGCCCGTTTTTCTCTAAAAAAAAAGCTGATTATTAGTTACAAACATAAGCTCTTAGGGTGGTAGCAGCTATGGACAGCAGCCCACCTTTTCCGAGTGAGAACACAGGAGGAAACAAGGTTGCAGCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016472
ATGGACAGCAGCCCACCTTTTCCGAGTGAGAACACAGGAGGAAACAAGGTTGCAGCTGTAGTCCTTGCCTTAGTAATTATACCAGTGATCGTCGTCGTCTCCTGCTACTGTGCCAAGAAGACGAGGGAGGCCATAGTGTCGGAGCTAAAGGCCGTAGTTGCCCCGCAGCTCCCATCAAGCATCCAAGTTTGGGAGGTCGACGCTCCCACCATGGAGAGGTTCTTCCTCGAACTGGCTCGAGACCAGCCCGTTCGTTTCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801160.1
MDSSPPFPSENTGGNKVAAVVLALVIIPVIVVVSCYCAKKTREAIVSELKAVVAPQLPSSIQVWEVDAPTMERFFLELARDQPVRFTAQQMFTFTDNYSTVLGCGGFGKVYKGQFPNGVKIAVKVLNRGGNSSVEEQFMAEVGTIGRTHHINLVKLYGFCYDQFMSALVYEFMEKGSLDKHLFSEARELEWEKLHEIAIGTAKGIAYLHEECQQRIIHYDIKPGNVLLDSNFNPKVADFGLAKLCNRDDTHVSVTGYRGT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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