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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002305`

染色体: Chr03 坐标: 36281485-36284227 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002305`
名称	SmilChr03G002305
描述	wall-associated receptor kinase 2-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	36281485 - 36284227 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016518`
GeneID	`131016518`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016518`
原始查询	`LOC131016518`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	wall-associated receptor kinase 2-like
产物	wall-associated receptor kinase 2-like
Arabidopsis	`AT1G21270` (WAK2) wall-associated kinase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838723] identity=44.4; qcov=0.949; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os04g0598900` (OsWAK50) - identity=44.6; qcov=0.972; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0007166 (cell surface receptor signaling pathway); GO:0030247 (polysaccharide binding)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07645 (EGF_CA); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF12947 (EGF_3); PF13947 (GUB_WAK_bind)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016518

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057801208.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801208.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801208.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801208.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801208.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:36281612`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B44,B69,C28,C38,C71
`Chr3:36281678`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr3:36281732`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr3:36281875`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B2,B33,C23
`Chr3:36281884`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr3:36281967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr3:36282271`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B35,B4,B64,C24,D11
`Chr3:36282292`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B130
`Chr3:36282292`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B130
`Chr3:36282361`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,B94
`Chr3:36282621`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B18,B69,C28,C38,C71
`Chr3:36282621`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B18,B69,C28,C38,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801208.1

739 aa

370

739

GUB_WAK_bind

EGF_CA

EGF_3

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF13947 GUB_WAK_bind 29-85 aa PF07645 EGF_CA 284-318 aa PF12947 EGF_3 292-319 aa PF00069 Pkinase 408-674 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 411-678 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801208.1`	Pfam	`PF13947`	GUB_WAK_bind	Domain	29	85	6e-09	36.9	Wall-associated receptor kinase galacturonan-binding
`XP_057801208.1`	Pfam	`PF07645`	EGF_CA	Domain	284	318	2.7e-10	41.0	Calcium-binding EGF domain
`XP_057801208.1`	Pfam	`PF12947`	EGF_3	Domain	292	319	2.2e-09	38.1	EGF domain
`XP_057801208.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	408	674	7.1e-50	170.6	Protein kinase domain
`XP_057801208.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	411	678	8.1e-47	160.4	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945225.1
AACAAAAAAGTCAAGTCAACCCAAACAACTAACATAGTACTCTGGAACTGATTCTAAGCATGAATACGACATCTTTGCTCGAACCTCTTCCCCTCAGTTGCTAAGAACTCCATCAACAATCATGTCTCCAAATCCTTCCTTCATCTCTCTCCTCTTTCTCCTCGTCTCTCTTCCTCTCTCTTCAAGCGACCTCGCCAAGCCCGGCTGCCCGACCAAATGCGGCAACGTAGCGGTCCCATACCCCTTCGGAATCGGCGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016518
ATGTCTCCAAATCCTTCCTTCATCTCTCTCCTCTTTCTCCTCGTCTCTCTTCCTCTCTCTTCAAGCGACCTCGCCAAGCCCGGCTGCCCGACCAAATGCGGCAACGTAGCGGTCCCATACCCCTTCGGAATCGGCGAAGGCTCAGGCTGCTCCTTCGACAAGCTGTTCGAGGTCACCTGCAACGACTCATTCGCCCCTCCAAGGCTGTTCGTCCCCGCAGCCGACATCGAGATCGTCGAGATACGGAACGACACCGTCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801208.1
MSPNPSFISLLFLLVSLPLSSSDLAKPGCPTKCGNVAVPYPFGIGEGSGCSFDKLFEVTCNDSFAPPRLFVPAADIEIVEIRNDTVRIKNMIASACYDPIGRVTSTSAASINLADTPFSVSDANMLTLVGCDDVFLMLGYMGRNFSSGCASLCSNKEDLIEGECSGIGCAQSNIPKGFRAFVSSIRSLQNHVNISSFDPCGYAFLGDPESFVFSASDLSDPSFLNRTRDNVPMILDWEINGVDNCSACHGNTICVDSATG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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