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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002311`

染色体: Chr03 坐标: 36372615-36374780 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002311`
名称	SmilChr03G002311
描述	uncharacterized SmilChr03G002311
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	36372615 - 36374780 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016525`
GeneID	`131016525`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016525`
原始查询	`LOC131016525`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=27.7; qcov=0.921; evalue=9.57e-68; confidence=low
Rice	`Os12g0597300` - identity=30.7; qcov=0.936; evalue=5.97e-76; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016525

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057801221.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801221.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801221.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801221.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057801221.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:36372747`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B14,B72,B94,C34,C40
`Chr3:36372809`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr3:36372837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C23,C5
`Chr3:36372837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C23,C5
`Chr3:36372870`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B20,B40
`Chr3:36372890`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr3:36372914`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B107,B130,C53,C87
`Chr3:36372928`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr3:36372932`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B91,C13,C27
`Chr3:36372957`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	69	A18,A19,A2,B100,B101,B107,B109,B114,B118,B119,B12,B120,B123,B126,B128,B13,B131,B137,B140,B17,B20,B23,B25,B27,B42,B43,B48,B49,B52,B56,B57,B6,B62,B66,B67,B79,B80,B83,B84,B87,B94,B96,B98,C12,C20,C23,C27,C40,C41,C43,C44,C47,C51,C55,C57,C59,C65,C72,C73,C78,C80,C83,C85,D11,D2,D4,D5,D7,D8
`Chr3:36372969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C61,C80
`Chr3:36372984`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B125,B90,B92

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801221.1

595 aa

298

595

MULE

Transposase_mut

SWIM

PF10551 MULE 188-282 aa PF00872 Transposase_mut 206-310 aa PF04434 SWIM 432-462 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801221.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	188	282	1.2e-19	71.2	MULE transposase domain
`XP_057801221.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	206	310	1.8e-09	37.7	Transposase, Mutator family
`XP_057801221.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	432	462	1.8e-07	31.3	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945238.1
TGATGATGATAGTAGAAATAGGCATAATGTACCTTCCTTAAGCAGCTCATTTGTGGATGTGGATGTAGAAGATGACATTTGGGATAGACAGATTGGGCATGGTCAACAATGGATCATTCCCGGTGCTCTATATCAAGCGTCACTTCCTTGTGAGGAATTAGGAATAACCAAAGGGTTCAACCGTGATACACTATCAGAAGGATCTACATTTATGGATAAAGAAAGCTTGAAGACTGCACTGGGGCTATATCATTTGGTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016525
ATGGATAAAGAAAGCTTGAAGACTGCACTGGGGCTATATCATTTGGTAAATCGTGTAGAATTTGTTGTTGAGCGATCTGATAAGTGTAGATTCTCAGTTGTTTGCAAGTATAGTGAACAATGCCCATTCTTACTACGTGCTACAGCGCATGGGACTGTTTGGAAGGTTATCAAATGGGTTGCTCCGCACAGTTGTCAGATTGACTTGAGAAATCACGGTCCTAGAACAGTGTCAGCAAGGACGATAGGAGCATTTTTTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801221.1
MDKESLKTALGLYHLVNRVEFVVERSDKCRFSVVCKYSEQCPFLLRATAHGTVWKVIKWVAPHSCQIDLRNHGPRTVSARTIGAFFAPTLMNEGAVLKPKEMQAQLRREYGFVVDYQMALIGRNHAISMIYGDTDKYFQLLPSYLYMLQESNPGSIVALQTDPVDRFQYVFMAIGACVNGFKSSCRPVIVVDGTHLKGKYRGIMFVAATKDGNEQVFPLAVGIGDKENDSSWIWFFNQLKRTFGCPDDLLFVSDQYRSIK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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