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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002320`

染色体: Chr03 坐标: 36553323-36555799 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002320`
名称	SmilChr03G002320
描述	protein SCO1 homolog 1, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	36553323 - 36555799 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016532`
GeneID	`131016532`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016532`
原始查询	`LOC131016532`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SCO1 homolog 1, mitochondrial
产物	protein SCO1 homolog 1%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT3G08950` (HCC1) electron transport SCO1/SenC family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820046] identity=74.1; qcov=0.685; evalue=2.05e-127; confidence=high
Rice	`Os09g0370200` - identity=40.3; qcov=0.63; evalue=1.4e-51; confidence=medium
GO	GO:0033617 (mitochondrial respiratory chain complex IV assembly)
KEGG	-
Pfam	PF00578 (AhpC-TSA); PF02630 (SCO1-SenC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016532

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057801227.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057801227.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057801227.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801227.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801227.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:36553552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr3:36553563`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr3:36553831`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr3:36553845`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr3:36554271`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr3:36555069`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr3:36555357`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,C53
`Chr3:36555583`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr3:36555629`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	105	A10,A11,A19,A25,A3,A4,A9,B101,B114,B117,B118,B119,B12,B122,B126,B131,B135,B137,B139,B14,B19,B2,B20,B22,B24,B25,B27,B28,B29,B30,B31,B33,B34,B39,B4,B40,B44,B52,B53,B55,B6,B60,B62,B64,B65,B67,B69,B70,B73,B74,B75,B77,B80,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B93,B96,B97,B98,C1,C11,C14,C17,C2,C20,C25,C27,C28,C3,C35,C36,C37,C38,C39,C42,C43,C44,C48,C53,C54,C55,C56,C57,C59,C63,C64,C66,C69,C70,C72,C76,C78,C80,C81,C84,C85,C87,C9,D11,D2,D9
`Chr3:36555635`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	117	A10,A11,A19,A25,A3,A4,A9,B1,B101,B11,B114,B117,B118,B119,B12,B122,B124,B126,B127,B131,B135,B137,B138,B139,B14,B19,B2,B20,B22,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B30,B31,B32,B33,B34,B39,B4,B40,B44,B52,B53,B55,B6,B60,B62,B63,B64,B65,B67,B69,B70,B73,B74,B75,B77,B80,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B93,B95,B96,B97,B98,C1,C11,C14,C17,C2,C20,C25,C27,C28,C3,C35,C36,C37,C38,C39,C42,C43,C44,C46,C48,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C63,C64,C66,C69,C70,C71,C72,C76,C78,C80,C81,C84,C85,C87,C9,D11,D2,D9
`Chr3:36555677`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	103	A1,A10,A11,A20,A25,A3,A4,B101,B11,B114,B117,B118,B119,B12,B121,B124,B127,B131,B135,B137,B138,B139,B14,B19,B2,B20,B22,B25,B26,B27,B28,B29,B30,B31,B33,B34,B39,B4,B41,B52,B53,B55,B6,B62,B63,B64,B65,B69,B70,B73,B74,B75,B77,B80,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B93,B95,B96,B97,B98,C11,C14,C17,C2,C20,C25,C27,C3,C35,C36,C37,C38,C39,C43,C44,C48,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C63,C64,C66,C67,C69,C71,C76,C78,C80,C84,C85,C9,D11,D2,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801227.1

327 aa

164

327

SCO1-SenC

AhpC-TSA

PF02630 SCO1-SenC 159-317 aa PF00578 AhpC-TSA 166-284 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801227.1`	Pfam	`PF02630`	SCO1-SenC	Domain	159	317	7.1e-59	198.9	SCO1/SenC
`XP_057801227.1`	Pfam	`PF00578`	AhpC-TSA	Domain	166	284	1.9e-08	35.0	AhpC/TSA family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945244.1
AATAATCATATGTAAGTGTAACAAATCTGGCAACATAAACCCCGGCGATAGGGTTTTTAGAAAGAGGCAAATAAAATTATCCCTCAATCTCATATCAGCTAGCAATGGCTTCAGCATTTCTGCGAAGTTCGACCCTCCGTCAATTCTGCTACTCCTTCAATTCTCGATTTCTCTCCTCCAGATTTCACAGTCTTCCTGAAAAATCGCTGCAGAATTCGCCGCTCGCCAGCAATCACTACGAACTACTGCGTGCTTTTTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016532
ATGGCTTCAGCATTTCTGCGAAGTTCGACCCTCCGTCAATTCTGCTACTCCTTCAATTCTCGATTTCTCTCCTCCAGATTTCACAGTCTTCCTGAAAAATCGCTGCAGAATTCGCCGCTCGCCAGCAATCACTACGAACTACTGCGTGCTTTTTCGGCGAACAATCGATTTTTGTGCACGAACGCGCCCAATCCAGGAGCTAGTCAATCGAATGTGAATGCGGCGGCGCAGCCTGGTGTGTCGTCGGCTCAGAGCGGTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801227.1
MASAFLRSSTLRQFCYSFNSRFLSSRFHSLPEKSLQNSPLASNHYELLRAFSANNRFLCTNAPNPGASQSNVNAAAQPGVSSAQSGSEKRNDGGQNSGGSENTQQQGKSVRGGPVSWMSFFLLFCTGVGLVYYYDREKRRHIEGLNKASSAVKQGPSVGKAAIGGPFNLVDHNGKTVSEKDFLGKWNLFYFGFTHCPDICPDELQKLASAIDKIKAKSGLEVVPVFISVDPERDTVEQVREYVKEFHPKLIGLTGSPDDV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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