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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002349`

染色体: Chr03 坐标: 37125107-37130887 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002349`
名称	SmilChr03G002349
描述	LIMR family protein At5g01460-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	37125107 - 37130887 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016541`
GeneID	`131016541`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016541`
原始查询	`LOC131016541`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	LIMR family protein At5g01460-like
产物	LIMR family protein At5g01460-like
Arabidopsis	`AT5G01460` (AT5G01460) LMBR1-like membrane protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831815] identity=85.1; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0128200` - identity=79.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	smil04977 (Vitamin digestion and absorption - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04791 (LMBR1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016541

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057801239.1`
2	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057801237.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057801237.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.20000	`XP_057801237.1`
5	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057801237.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:37125580`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr3:37125730`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,B121,B130,B36,B95
`Chr3:37125895`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B67
`Chr3:37125895`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B67
`Chr3:37125928`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr3:37125951`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr3:37126976`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr3:37127722`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr3:37127933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr3:37127961`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,B121,B130,B36,B95
`Chr3:37128521`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr3:37129126`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B48,B66,C44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801237.1

545 aa

272

545

LMBR1

PF04791 LMBR1 9-274 aa PF04791 LMBR1 262-487 aa

XP_057801239.1

509 aa

254

509

LMBR1

PF04791 LMBR1 9-273 aa PF04791 LMBR1 260-487 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801237.1`	Pfam	`PF04791`	LMBR1	Family	9	274	9.4e-70	236.6	LMBR1-like membrane protein
`XP_057801237.1`	Pfam	`PF04791`	LMBR1	Family	262	487	9.4e-70	236.6	LMBR1-like membrane protein
`XP_057801239.1`	Pfam	`PF04791`	LMBR1	Family	9	273	6e-70	237.3	LMBR1-like membrane protein
`XP_057801239.1`	Pfam	`PF04791`	LMBR1	Family	260	487	6e-70	237.3	LMBR1-like membrane protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945256.1
GAGTGAGGCTGGAATTTTGCTGGCTTTATTCAAAATATTTACAGATGAAAAAAAGAAATTAAAGAAAAGAAGAAACCGCCGATTTCCAGCGCTATGCTGGGGAATTTAAAAACTTGAGCAGGGTCAATATGGGAAACTTAGTTCCAACGCGTGAGCCTTGTTTCACTTTCACCCACTCTCTCTCTCTCTCTCGTCGAAACCGTCACCGGAACTCACCTTCTCTCTCTACCAGATCTACAAACCCTACAATTCTAAATTAC...

XM_057945254.1
GCTGGAATTTTGCTGGCTTTATTCAAAATATTTACAGATGAAAAAAAGAAATTAAAGAAAAGAAGAAACCGCCGATTTCCAGCGCTATGCTGGGGAATTTAAAAACTTGAGCAGGGTCAATATGGGAAACTTAGTTCCAACGCGTGAGCCTTGTTTCACTTTCACCCACTCTCTCTCTCTCTCTCGTCGAAACCGTCACCGGAACTCACCTTCTCTCTCTACCAGATCTACAAACCCTACAATTCTAAATTACCCAAGCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016541
ATGGGGGATTTTAATTTAGCCCTAGTGATCGTGGCGATAGTCGTCTGCGTGATCGTTTTCCTAGTTAACGTCTACCTTCTCGTCAACTACCAGCATCCTGATGATAAGAACCAGGCCTACTTCCCCAAATTCGTCGTCGTCTTCGGCCTTACGATCGCCGCTATCTCGATTCTCATGCTTCCGGCCGACGTCGCTAACCGGCAGGCCTGCCGCCACGCGATTTACAATGGGGCTTGTAACCTGACTCTGCCGATGAAGGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057801237.1
MGDFNLALVIVAIVVCVIVFLVNVYLLVNYQHPDDKNQAYFPKFVVVFGLTIAAISILMLPADVANRQACRHAIYNGACNLTLPMKDLWLAIYIVDAFLVFFVIPFAMFYYEGDQDKSVWKRMRSALIWVVVTAIVCGLVLAIMYGLVGKVDFTVRHLSSTTMSFPSTWDFSNSQQCVGTGARQCSAYSASASSESTWTMRTTFPEYVVALTTIVGSVLFTIFGGVGIACLPLGLIFSFVRRPKAVITRSQYIKEATELA...

XP_057801239.1
MGDFNLALVIVAIVVCVIVFLVNVYLLVNYQHPDDKNQAYFPKFVVVFGLTIAAISILMLPADVANRQACRHAIYNGACNLTLPMKDLWLAIYIVDAFLVFFVIPFAMFYYEGDQDKSVWKRMRSALIWVVVTAIVCGLVLAIMYGLVGKVDFTVRHLSSTTMSFPSTWDFSNSQQCVGTGARQCSAYSASASSESTWTMRTTFPEYVVALTTIVGSVLFTIFGGVGIACLPLGLIFSFVRRPKAVITRSQYIKEATELA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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