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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002352`

染色体: Chr03 坐标: 37158968-37164609 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002352`
名称	SmilChr03G002352
描述	vacuolar cation/proton exchanger 3-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	37158968 - 37164609 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016544`
GeneID	`131016544`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016544`
原始查询	`LOC131016544`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vacuolar cation/proton exchanger 3-like
产物	vacuolar cation/proton exchanger 3-like
Arabidopsis	`AT3G51860` (CAX3) cation exchanger 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824349] identity=71.5; qcov=0.963; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0557500` (OsCAX1a) - identity=66.3; qcov=0.932; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006874 (intracellular calcium ion homeostasis); GO:0009705 (plant-type vacuole membrane); GO:0015369 (calcium:proton antiporter activity); GO:0070588 (calcium ion transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF01699 (Na_Ca_ex)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016544

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057801245.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057801245.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.60000	`XP_057801245.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801245.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801245.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:37159244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr3:37159351`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr3:37159352`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B52,C54
`Chr3:37159445`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr3:37162810`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr3:37163435`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr3:37163460`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	A4
`Chr3:37163460`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	A4
`Chr3:37163632`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801245.1

456 aa

228

456

Na_Ca_ex

PF01699 Na_Ca_ex 99-256 aa PF01699 Na_Ca_ex 286-428 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801245.1`	Pfam	`PF01699`	Na_Ca_ex	Family	99	256	4e-40	138.0	Sodium/calcium exchanger protein
`XP_057801245.1`	Pfam	`PF01699`	Na_Ca_ex	Family	286	428	4e-40	138.0	Sodium/calcium exchanger protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009099064.1
TAGCGCAAAACACAACAGAAATTCAAATAAGAAACACCACTCCCCACTTCCATTTCAAACCTACAAATTATTTGAGCAGAGAGAGAGAGTGGGTGAAGAAGTGAAGGAGCAAAATGGCATCAACAAAACAAGATTTGGGGAAAATGGCGGCGCCTGACCAATGGCTGCTTGAAAATGGAAACATTAAGCTGCTGAGCAGAGAGCGGCGCGGGCGTAGCGCCCATAACATGTCTTCTTCTTCCCTGCGGAAGAAATCGGAT...

XM_057945262.1
CTCTAAAATACAATGCATTGAAGATGGGTGTGTCTTAGATGGGAACCACCACCTCAGACCCCCTCTAAGACACCATACTGGAGATGCTATTAGAGTCTCTATATATACGCACACAAATTTAGCGCAAAACACAACAGAAATTCAAATAAGAAACACCACTCCCCACTTCCATTTCAAACCTACAAATTATTTGAGCAGAGAGAGAGAGTGGGTGAAGAAGTGAAGGAGCAAAATGGCATCAACAAAACAAGATTTGGGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016544
ATGGCATCAACAAAACAAGATTTGGGGAAAATGGCGGCGCCTGACCAATGGCTGCTTGAAAATGGAAACATTAAGCTGCTGAGCAGAGAGCGGCGCGGGCGTAGCGCCCATAACATGTCTTCTTCTTCCCTGCGGAAGAAATCGGATCGGACCCTCGTTTCCAAGGTTCGGGTCGGCTGCCTGCGCAAGTTGTTGACCAATCTTCAAGAAGTTTTGCTCGGAACCAAGCTTGCCATTTTGTTTCTCGCCATTCCTTTCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801245.1
MASTKQDLGKMAAPDQWLLENGNIKLLSRERRGRSAHNMSSSSLRKKSDRTLVSKVRVGCLRKLLTNLQEVLLGTKLAILFLAIPFAIIAEYRNFGRPWIFALSLLGLTPLAERISFLTEQIAFFTGPTVGGLLNATCGNATELIIAILALVQNKVDVVKYSLLGSILSNLLLVLGTSLLCGGIVNISKEQKFDRKQADVNSLLLLLGLLCHLLPLMFTFVGKTPEIAAVGTLQLSRASCFIMLVAYIAYLVFQLWTHRE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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