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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002339`

染色体: Chr03 坐标: 36864792-36867431 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002339`
名称	SmilChr03G002339
描述	uncharacterized SmilChr03G002339
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	36864792 - 36867431 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016546`
GeneID	`131016546`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016546`
原始查询	`LOC131016546`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835977]; symbol=TRM31; hit=AT5G58630; species=arabidopsis; confidence=low
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835977]; symbol=TRM31; hit=AT5G58630; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G58630` (TRM31) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835977] identity=34.5; qcov=0.483; evalue=1.21e-14; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14383 (VARLMGL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016546

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057801248.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057801248.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057801248.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057801248.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801248.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:36865217`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B127,B138,B37,B95
`Chr3:36865343`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr3:36865406`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:36865535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B108,B33,C23
`Chr3:36866985`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:36867019`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,B121,B130,B36,B95
`Chr3:36867022`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B8
`Chr3:36867022`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B8
`Chr3:36867073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B99
`Chr3:36867182`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,C18
`Chr3:36867268`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	20	B112,B129,B15,B19,B31,B52,B83,B90,B92,C11,C18,C2,C35,C48,C59,C61,C63,C69,C79,C9
`Chr3:36867271`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	20	B112,B129,B15,B19,B31,B52,B83,B90,B92,C11,C18,C2,C35,C48,C59,C61,C63,C69,C79,C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801248.1

354 aa

177

354

VARLMGL

PF14383 VARLMGL 52-73 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801248.1`	Pfam	`PF14383`	VARLMGL	Domain	52	73	1.1e-07	32.0	DUF761-associated sequence motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945265.1
GACCCATTGGAATGTTGGCCACGCATGCATCGGAATCGGATGAAGCAAAAACTCCAATGTGAACACGCACGCACAAACAGTTCCAAAATATGGAGGCGTGTCTGCCAATTTTTCTACATCTATAGTGTGAATCCAAACCCCTTAATTCAAGCCGCGTCATCTTCTACACCATTCTCATCAAATATATATCTCAATAATTCATCTCCTTCCTCACAACTATTCACGCCACTCTTCATCCATGTGCATGTAGTGCGTGAAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016546
ATGCCGGAATCTCGCCAAACTAGCTCCACCAAATGCTTCTCCGCCGTTCTCAGCCGGTTGCTTTGCTCCGGCGGCCTCCCCACGCACCCCTCGGAGCAGTTAATCGAGCCGAGTGTCGAAAAATTCGAGTTTCCGAAGCCTCAGGAGAATGCGAAGAGGAGCTCGAGCCCGGGAGTGGTGGCCAGATTAATGGGGCTGGAATCGTTTCCTGCAGAGAATCACAATAAGGAGAGAACATTGGGCGATTTCTTCAGAAGTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801248.1
MPESRQTSSTKCFSAVLSRLLCSGGLPTHPSEQLIEPSVEKFEFPKPQENAKRSSSPGVVARLMGLESFPAENHNKERTLGDFFRSRSVNSIDFLSHFDPRKHQHRRVRTSVSFREGVSDDFASVFLLLEEEFQAKINEDMRGNRVSNEKNVEIQEKRKSVYGKNVEIKEKKGSVSSKKKGDLEGKRRADLKERRTLTKGVKCEEELKKKKKKKSKILGHNKLNFDFKKIHPQGAATEVARVGSPRKHQPSPTASSQSQS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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