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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002337`

染色体: Chr03 坐标: 36851140-36852520 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002337`
名称	SmilChr03G002337
描述	PHD finger-like domain-containing protein 5A
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	36851140 - 36852520 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016556`
GeneID	`131016556`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016556`
原始查询	`LOC131016556`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PHD finger-like domain-containing protein 5A
产物	PHD finger-like domain-containing protein 5A
Arabidopsis	`AT2G30000` (AT2G30000) PHF5-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817551] identity=98.2; qcov=1; evalue=6.17e-75; confidence=high
Rice	`Os04g0663300` - identity=97.3; qcov=1; evalue=6.38e-75; confidence=high
GO	GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0005686 (U2 snRNP); GO:0005689 (U12-type spliceosomal complex); GO:0071011 (precatalytic spliceosome); GO:0071013 (catalytic step 2 spliceosome)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03660 (PHF5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016556

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057801268.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057801268.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057801268.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057801268.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801268.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:36852021`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr3:36852158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr3:36852161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr3:36852176`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr3:36852284`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801268.1

110 aa

110

PHF5

PF03660 PHF5 10-104 aa

XP_057801269.1

110 aa

110

PHF5

PF03660 PHF5 10-104 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801268.1`	Pfam	`PF03660`	PHF5	Domain	10	104	4.3e-44	149.4	PHF5-like protein
`XP_057801269.1`	Pfam	`PF03660`	PHF5	Domain	10	104	4.3e-44	149.4	PHF5-like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945285.1
AAATGTTATTTTGAAGTCTTGAGGGCTCAAACTGTAAATCTACTAAAGTTTCACCTATAAACCACTAATAATAGGAAATGGACAAGGGGAAGTAGAAATCGGGACGCCGTCGCCTCCTTTTTTGGGATTTCAATTCGCACTCTTCGCCGCCGCAGAGAATAGTGATAAAAGTGTCGCAGAAGCATGGCTAAACATCATCCTGACTTGATCATGTGTCGTAAGCAACCAGGCATTGCCATTGGAAGGCTGTGCGAGAAAGA...

XM_057945286.1
AATCGGGACGCCGTCGCCTCCTTTTTTGGGATTTCAATTCGCACTCTTCGCCGCCGCAGGTTCCTCTCTCTTTCTCTCTGTGCTGCCATACACAGCTGAACAATCTTGCAGTAGGGGATACCTCGCCCTAATTCAATTATTCCAGTAGAATAGTGATAAAAGTGTCGCAGAAGCATGGCTAAACATCATCCTGACTTGATCATGTGTCGTAAGCAACCAGGCATTGCCATTGGAAGGCTGTGCGAGAAAGATGATGGGAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016556
ATGGCTAAACATCATCCTGACTTGATCATGTGTCGTAAGCAACCAGGCATTGCCATTGGAAGGCTGTGCGAGAAAGATGATGGGAAATGTGTGATATGCGATTCCTATGTGCGCCCTTGCACGCTTGTGAGGATATGTGATGAGTGCAACTACGGGTCTTTCCAAGGTCGGTGTGTTATCTGTGGCGGGGTGGGGATCTCGGACGCCTACTACTGCAAGGAGTGCACTCAGCTGGAGAAGGACAGAGATGGGTGCCCCAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057801268.1
MAKHHPDLIMCRKQPGIAIGRLCEKDDGKCVICDSYVRPCTLVRICDECNYGSFQGRCVICGGVGISDAYYCKECTQLEKDRDGCPKIVNLGSAKTDLFYERKKYGFKKR

XP_057801269.1
MAKHHPDLIMCRKQPGIAIGRLCEKDDGKCVICDSYVRPCTLVRICDECNYGSFQGRCVICGGVGISDAYYCKECTQLEKDRDGCPKIVNLGSAKTDLFYERKKYGFKKR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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