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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002375`

染色体: Chr03 坐标: 37392720-37397004 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002375`
名称	SmilChr03G002375
描述	auxin transporter-like protein 2
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	37392720 - 37397004 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016581`
GeneID	`131016581`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016581`
原始查询	`LOC131016581`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	auxin transporter-like protein 2
产物	auxin transporter-like protein 2
Arabidopsis	`AT2G38120` (AUX1) Transmembrane amino acid transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818390] identity=84.3; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0856500` (OsLAX1) - identity=82.3; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01490 (Aa_trans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016581

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057801275.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801275.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801275.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801275.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801275.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:37392915`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B55
`Chr3:37392915`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B55
`Chr3:37392926`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C23
`Chr3:37392928`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr3:37392949`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B55,C27
`Chr3:37392949`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B55,C27
`Chr3:37392967`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B55,C27
`Chr3:37392967`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B55,C27
`Chr3:37393064`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B4,B9,B94
`Chr3:37393840`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr3:37393877`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr3:37393908`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801275.1

478 aa

239

478

Aa_trans

PF01490 Aa_trans 44-437 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801275.1`	Pfam	`PF01490`	Aa_trans	Domain	44	437	1.7e-86	291.2	Transmembrane amino acid transporter protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945292.1
TCCTCAAATTCACAAAAAAGAAAGAAATAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGGAAATTTAAAAGAAAAGAAAATCGTTATTAATTCACACACACTGACACACTCTCACAGCCTAGTTGTTGAGTAGTACTTATAAATATGTGCTGCTTTAATAGTAGCAGAAAGTCCTCTTTTTGCTCCTCACTCTCTCTCTCTCTCTCATTCATTTTTCTGAGCTAGAATTTTTTTGTGCTTTTGAGGTAATTCTCGCCGCCTTCAGCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016581
ATGTTGGCACAGAAGCAAGCAGAGGAAGCCATTGTCTCCACCTTCAACGAGACTGAAAATGACGGCGGCAAGGACGCGGCGGAGCAGGCGGAGCAGCAGCCCATTTTCAGCGTCAAAAACGCCCTCTGGCACGGCGGCTCCGCCTGGGACGCCTGGTTCAGCTGCTCTTCCAACCAAGTTGCTCAAGTGTTGCTGACGCTTCCATACTCTTTTTCCCAACTGGGAATGCTGTCTGGAATCATTTTTCAAGTATTTTATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801275.1
MLAQKQAEEAIVSTFNETENDGGKDAAEQAEQQPIFSVKNALWHGGSAWDAWFSCSSNQVAQVLLTLPYSFSQLGMLSGIIFQVFYGLIGSWTAYLISVLYIEYRSRKEKEGVSFKNHVIQWFEVLDGLLGPYWKAVGLAFNCTFLLFGSVIQLIGCASNIYYVNDHLDKRTWTYIFGACCATTVFIPSFHNYRIWSFLGLGMTTYTAWYMTIAALVHGQAEDVHHSGPKKLVLYFTGATNILYTFGGHAVTVEIMHAMW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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