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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002398`

染色体: Chr03 坐标: 37985835-37989116 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002398`
名称	SmilChr03G002398
描述	protein OCTOPUS-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	37985835 - 37989116 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016592`
GeneID	`131016592`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016592`
原始查询	`LOC131016592`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein OCTOPUS-like
产物	protein OCTOPUS-like
Arabidopsis	`AT3G09070` (OPS) LOW protein: UPF0503-like protein, putative (DUF740) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820060] identity=42.2; qcov=0.989; evalue=3.23e-103; confidence=medium
Rice	`Os01g0852400` - identity=37.6; qcov=0.989; evalue=8.81e-83; confidence=medium
GO	GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF05340 (DUF740)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016592

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057801285.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057801285.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801285.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801285.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801285.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:37986298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr3:37986306`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B12,B124,B49,B6,B79,C33,C4
`Chr3:37986315`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	77	A1,A10,A14,A16,A18,A23,A24,A5,B10,B100,B104,B11,B112,B114,B12,B120,B124,B129,B131,B136,B140,B19,B20,B22,B25,B30,B31,B41,B42,B43,B5,B55,B57,B60,B63,B65,B68,B70,B75,B76,B78,B79,B88,B89,B90,B91,B92,B97,C1,C11,C17,C18,C2,C24,C26,C27,C28,C35,C37,C40,C41,C48,C52,C59,C61,C63,C69,C7,C79,C8,C84,C86,C87,C9,D2,D3,D9
`Chr3:37986316`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr3:37986329`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	13	A1,A14,A24,A25,B100,B41,B65,B89,B91,C17,C7,C87,D5
`Chr3:37986340`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B69,B82,C1
`Chr3:37986345`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr3:37986353`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B140,C19,C31,C68,C74,D2,D9
`Chr3:37986389`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr3:37986391`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	51	A1,A14,A24,A25,A7,B100,B102,B103,B110,B134,B137,B139,B14,B16,B27,B29,B30,B36,B41,B45,B48,B50,B51,B61,B65,B7,B70,B89,B91,C10,C15,C17,C19,C21,C30,C31,C35,C5,C50,C6,C60,C61,C68,C7,C70,C74,C75,C76,C87,D2,D9
`Chr3:37986392`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C24
`Chr3:37986392`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801285.1

659 aa

330

659

DUF740

PF05340 DUF740 17-578 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801285.1`	Pfam	`PF05340`	DUF740	Family	17	578	5.7e-199	663.6	Protein of unknown function (DUF740)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945302.1
TCTTCTTCTTTAATTCCTGTCTCCTCCTATACTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACCACACACAGTGACCAATGAAGCTACATTGCGGAGCGCAATGGTGTTAGTACCATGAACAGGGGAAGGGACGGGTACACATGCTTCCAACGGTTATGAATCATCCCACTTCCACAGACCCAACAGCTCCGCCTCCGCCGCCGCCGCCGCGATCCTCCTTCAGCTGCGACCGCCACCCTACCGAGCAGTTCACCGGCTTCTGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016592
ATGCTTCCAACGGTTATGAATCATCCCACTTCCACAGACCCAACAGCTCCGCCTCCGCCGCCGCCGCCGCGATCCTCCTTCAGCTGCGACCGCCACCCTACCGAGCAGTTCACCGGCTTCTGCCCCTCCTGTCTCTGCGAGCGCCTCACCACGCTAGATAACTCCTCCTCCAACACCCCCTCCTCCTCCCGCCGCCCGTCTTCTGCTTCCGCCGCCATAAAGTCCCTCTTCTCCTCCGCCTCAAAACCCAGCAGCAGCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801285.1
MLPTVMNHPTSTDPTAPPPPPPPRSSFSCDRHPTEQFTGFCPSCLCERLTTLDNSSSNTPSSSRRPSSASAAIKSLFSSASKPSSSFPPPPPPPKPSKPSSSFPELRRSKSFSASKNEALGQFFEPQRKSCDVRVRNTLWTLFTLDDDGGGSKPSAAAAASSSSHQNGKKIGSFSAEKPVFEETENDDDFRDSEYAEIDEIQSVRESHLENSRNEVEFEVNSAKIVEEEANLKIKEHIDLQTQEKKSSSGGFWAAASVFS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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