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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002419`

染色体: Chr03 坐标: 38421229-38424834 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002419`
名称	SmilChr03G002419
描述	fructokinase-like 1, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	38421229 - 38424834 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016607`
GeneID	`131016607`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016607`
原始查询	`LOC131016607`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	fructokinase-like 1, chloroplastic
产物	fructokinase-like 1%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G54090` (FLN1) fructokinase-like 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824576] identity=68.6; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0851000` (WLP2) - identity=59.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0009658 (chloroplast organization); GO:0016301 (kinase activity); GO:0042644 (chloroplast nucleoid); GO:0042793 (plastid transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00294 (PfkB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016607

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057801296.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057801296.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801296.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801296.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801296.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:38422730`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr3:38422752`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,B127
`Chr3:38423032`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr3:38423075`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B33,C23,C83
`Chr3:38423349`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr3:38423884`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,B57
`Chr3:38423919`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr3:38423959`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B101,B94
`Chr3:38423966`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A14,B11,B138,B37,B61,B9,B90,C80
`Chr3:38423967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B114,C56,D4
`Chr3:38424019`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,B7
`Chr3:38424021`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,C18,C35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801296.1

473 aa

236

473

PfkB

PF00294 PfkB 137-437 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801296.1`	Pfam	`PF00294`	PfkB	Domain	137	437	1.8e-30	107.0	pfkB family carbohydrate kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009099102.1
GATACACTCAGGCCTACTTCTCTCTCCTTCCCTTATCTCGATAACAAAGAGAAATGGTAATTGGATAAACCGTTAAAACCCTGAAACTGAAGAGAGAAAAAATGGCAACTCTTGAGCTCCTACTCCACCATTCTCACTCATTTGCCCTAAGTCAGCACCCCATCATCAATTTCTCAAGTTTTCGCCCAATTTACCCCAAATTACCGCCTATCAAATCCTCCGCCACTGATTCTCCATCCACCAGCTCCACCACCCCCCGC...

XR_009099103.1
GATACACTCAGGCCTACTTCTCTCTCCTTCCCTTATCTCGATAACAAAGAGAAATGGTAATTGGATAAACCGTTAAAACCCTGAAACTGAAGAGAGAAAAAATGGCAACTCTTGAGCTCCTACTCCACCATTCTCACTCATTTGCCCTAAGTCAGCACCCCATCATCAATTTCTCAAGTTTTCGCCCAATTTACCCCAAATTACCGCCTATCAAATCCTCCGCCACTGATTCTCCATCCACCAGCTCCACCACCCCCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016607
ATGGCAACTCTTGAGCTCCTACTCCACCATTCTCACTCATTTGCCCTAAGTCAGCACCCCATCATCAATTTCTCAAGTTTTCGCCCAATTTACCCCAAATTACCGCCTATCAAATCCTCCGCCACTGATTCTCCATCCACCAGCTCCACCACCCCCCGCCGCGGCCGCAAAAAATCCACCACCACCACCACCTCCACAACGAAAAGATCAAGGCGGCCGAGGAAATCAGGAGATTCGCCAGACACCAAAAATGTCGACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801296.1
MATLELLLHHSHSFALSQHPIINFSSFRPIYPKLPPIKSSATDSPSTSSTTPRRGRKKSTTTTTSTTKRSRRPRKSGDSPDTKNVDDELYDYDDGVDFPYLDPPLVCCFGAAQKEFVPTVRVAPEQMHPDIYSQWKMLQWNPPEFARAPGGAPSNVAISHVRLGGRAAFMGKVGKDEFGEELVLMMNKERVQTRGVKFDDKARTACSYMKIKFEEGKMSAENVKECPEDSLLGSELNLAVLKEARIFHFTSEVLTSTSMR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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