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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002437`

染色体: Chr03 坐标: 38692081-38694043 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002437`
名称	SmilChr03G002437
描述	uncharacterized SmilChr03G002437
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	38692081 - 38694043 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016619`
GeneID	`131016619`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016619`
原始查询	`LOC131016619`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0850000; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os01g0850000; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G54000` (AT3G54000) TIP41-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824567] identity=25.6; qcov=0.938; evalue=2.68e-07; confidence=low
Rice	`Os01g0850000` - identity=30.9; qcov=1.16; evalue=2.4e-23; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF27723 (UCP022260)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016619

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057801309.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057801309.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057801310.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801309.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801309.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:38692485`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,B83
`Chr3:38692534`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr3:38692536`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B127,B99
`Chr3:38692538`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr3:38692726`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B127,B99
`Chr3:38692767`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,B57
`Chr3:38692980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,C19,D6
`Chr3:38693012`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,C19,D6
`Chr3:38693035`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,B95,B98
`Chr3:38693442`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,C64
`Chr3:38693479`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B123,B46,C37
`Chr3:38693733`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B123,B46,C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801309.1

333 aa

166

333

UCP022260

PF27723 UCP022260 4-273 aa

XP_057801310.1

325 aa

162

325

UCP022260

PF27723 UCP022260 3-265 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801309.1`	Pfam	`PF27723`	UCP022260	Family	4	273	5.5e-36	125.1	Uncharacterised conserved protein UCP022260
`XP_057801310.1`	Pfam	`PF27723`	UCP022260	Family	3	265	1e-27	97.9	Uncharacterised conserved protein UCP022260

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945327.1
GATTATTTCAATAAAATAAAAATCAAAAATTATTCCACCCGCTTCCAACTTCCCGGCACACAAACTGAAACTGCCTCTTTCTCTCTCTCTAGACGTAAAATTGTGGTGGGTCCCACATTTAAGTGGGGGCTATAATTAAAGCTTCAAGAGGCAGCCTCCCTCCCTTCTCCATCACATCCGTAATCCCCGCCTTTGATATTTTCCCAGTCTTGCGCAATTCTACCTACATATACACACACCACTCTGCTTTCCTCTCAACT...

XM_057945326.1
TTTCAATAAAATAAAAATCAAAAATTATTCCACCCGCTTCCAACTTCCCGGCACACAAACTGAAACTGCCTCTTTCTCTCTCTCTAGACGTAAAATTGTGGTGGGTCCCACATTTAAGTGGGGGCTATAATTAAAGCTTCAAGAGGCAGCCTCCCTCCCTTCTCCATCACATCCGTAATCCCCGCCTTTGATATTTTCCCAGTCTTGCGCAATTCTACCTACATATACACACACCACTCTGCTTTCCTCTCAACTATGGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016619
ATGGCGCGAGATTTGGGGTTCTGGCTTCCCTCCGAGTTTCTCACGGACGACGACCTGCTCACAGACTTCACTTCGCCCCCCGAGGACGATGACCTCGTCGCCGACTTGACTCGGAAGCTTGCTCACTCTGCTTTACTCACCGACTACGCTTCAAAAGGCTGGAAGCGGTCCGGTTCGCCGCAATCGACTCTGTGCGGGTGCCAGCCCGGCCCGACGGTTAGCCCGAACTCCGTATCCGGCTTCTGCTCACCAACGGATGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057801309.1
MARDLGFWLPSEFLTDDDLLTDFTSPPEDDDLVADLTRKLAHSALLTDYASKGWKRSGSPQSTLCGCQPGPTVSPNSVSGFCSPTDAEDYLRRDLLHAAAEEVVRIRMIEETAAFYSSKHFPPQSKPRTGAGPQLSPNSASAFNTNQAPSQTHLSSQLLQVARMKQQMMKNGDNMTGVTEFQLRNGRGNGGEGRAPMAAWPGFQQPGSGMRAVYLGEPGPKKERTGTGVFLPQRVSSLPAENRKKSVCPTVVLPEKVVHA...

XP_057801310.1
MARDLGFWLPSEFLTDDDLLTDFTSPPEDDDLVADLTRKLAHSALLTDYASKGWKRSGSPQSTLCGCQPGPTVSPNSVSGFCSPTDAEDYLRRDLLHAAAEEVVRIRMIEETAAFYSSKHFPPQSKPRTGAGPQLSPNSASAFNTNQAPSQTHLSSQLLQVARMKQQMMKNGDNMTGVTEFQLRNGRGNGGEGRAPMAAWPGFQQPGSGMRAVYLGEPGPKKERTGTGVFLPQRVSSLPAENRKKSEKVVHALNINVDSI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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