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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002451`

染色体: Chr03 坐标: 38885932-38887803 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002451`
名称	SmilChr03G002451
描述	probable glutathione S-transferase
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	38885932 - 38887803 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016622`
GeneID	`131016622`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016622`
原始查询	`LOC131016622`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable glutathione S-transferase
产物	probable glutathione S-transferase
Arabidopsis	`AT3G09270` (GSTU8) glutathione S-transferase TAU 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820083] identity=51; qcov=0.981; evalue=8.24e-72; confidence=high
Rice	`Os01g0949800` (OsGSTU36) - identity=43.8; qcov=1; evalue=1.49e-61; confidence=medium
GO	GO:0004364 (glutathione transferase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006749 (glutathione metabolic process)
KEGG	smil00480 (Glutathione metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00043 (GST_C); PF02798 (GST_N); PF13409 (GST_N_2); PF13417 (GST_N_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016622

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057801313.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057801313.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801313.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801313.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801313.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:38886152`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B48
`Chr3:38886270`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:38886315`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B124,B49,B79
`Chr3:38887549`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B91,C39,C67
`Chr3:38887549`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B91,C39,C67
`Chr3:38887555`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B91,C39
`Chr3:38887555`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B91,C39
`Chr3:38887564`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B91,C39,C67
`Chr3:38887565`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C39
`Chr3:38887565`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C39
`Chr3:38887614`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	21	A14,A16,A23,A25,A5,B121,B130,B136,B138,B15,B26,B32,B63,B73,B84,C11,C16,C69,C73,C84,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801313.1

210 aa

105

210

GST_N

GST_N_3

GST_N_2

GST_C

PF02798 GST_N 3-75 aa PF13417 GST_N_3 8-80 aa PF13409 GST_N_2 11-75 aa PF00043 GST_C 118-187 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801313.1`	Pfam	`PF02798`	GST_N	Domain	3	75	4.1e-20	72.6	Glutathione S-transferase, N-terminal domain
`XP_057801313.1`	Pfam	`PF13417`	GST_N_3	Domain	8	80	5.9e-14	52.9	Glutathione S-transferase, N-terminal domain
`XP_057801313.1`	Pfam	`PF13409`	GST_N_2	Domain	11	75	8.8e-12	46.2	Glutathione S-transferase, N-terminal domain
`XP_057801313.1`	Pfam	`PF00043`	GST_C	Domain	118	187	1.9e-11	44.7	Glutathione S-transferase, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945330.1
TGACCAATTAAAAGAGCTAGAATTAAATGTCAACAGAGGCGGCTGGGATCATTTTATTTTTTTGGCACGGAAGTTTCTTCGTTCAAGTTATTATAAGCAGGTATGGAATGATGAGTACTGAAATAGCATTGTAGAGAGAGATGTCGAAAGTGAAGGTGCTAGGATTCTGGTATAGCCCCTTTGTGACAAGAGTGAAAATGGCCCTAAAAATGAAAGGTGTGGAATTCGAATACATTGAAGAAAATAGCAGAAGCAAGTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016622
ATGTCGAAAGTGAAGGTGCTAGGATTCTGGTATAGCCCCTTTGTGACAAGAGTGAAAATGGCCCTAAAAATGAAAGGTGTGGAATTCGAATACATTGAAGAAAATAGCAGAAGCAAGTCCCATCTTCTTCTGCAATCCAATCCAATTCACAAAAAAGTGCCAGTTTTGTTGCACGATGGGAAGCCCATAGTTGAAACGATGATCATTCTTGAATACATCGACCAAACTTGGGAAGGTCCATCCATTCTGCCTCGCGATCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801313.1
MSKVKVLGFWYSPFVTRVKMALKMKGVEFEYIEENSRSKSHLLLQSNPIHKKVPVLLHDGKPIVETMIILEYIDQTWEGPSILPRDPYQRAMARFWVNFIDEKCMNTMLKACWRTGEEQVKFKEEAIEALQFLENEIKGKKYFGGEEIGVVDHAANFIAFWYPIVSSGFQLMTEEKFPNMCRWARDYCNDSFVKENLPPRSDMVSKFMRG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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