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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001270`

染色体: Chr01 坐标: 25381022-25384673 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001270`
名称	SmilChr01G001270
描述	rhodanese-like/PpiC domain-containing protein 12, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	25381022 - 25384673 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016628`
GeneID	`131016628`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016628`
原始查询	`LOC131016628`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rhodanese-like/PpiC domain-containing protein 12, chloroplastic
产物	rhodanese-like/PpiC domain-containing protein 12%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G19370` (AT5G19370) rhodanese-like domain-containing protein / PPIC-type PPIASE domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832057] identity=69.2; qcov=0.705; evalue=2.47e-106; confidence=high
Rice	`Os07g0687500` (OsStr16) - identity=72.5; qcov=0.739; evalue=1.38e-120; confidence=high
GO	GO:0003755 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00581 (Rhodanese); PF00639 (Rotamase); PF13616 (Rotamase_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016628

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057801322.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057801322.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.60000	`XP_057801323.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801322.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801322.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:25381278`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr1:25381844`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr1:25381901`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B21,B44,C73
`Chr1:25384180`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	71	A7,B1,B101,B103,B104,B105,B106,B109,B122,B127,B13,B130,B135,B138,B17,B2,B23,B24,B27,B35,B4,B55,B58,B65,B67,B68,B69,B74,B78,B79,B80,B81,B84,B85,B86,B89,B94,B95,B99,C13,C14,C17,C2,C20,C21,C25,C26,C28,C29,C3,C36,C39,C4,C41,C42,C44,C48,C49,C5,C51,C52,C71,C74,C75,C86,C87,C9,D1,D2,D4,D7
`Chr1:25384482`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr1:25384521`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B104,B50,B67,C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801322.1

299 aa

150

299

Rotamase_3

Rotamase

Rhodanese

PF13616 Rotamase_3 98-177 aa PF00639 Rotamase 99-175 aa PF00581 Rhodanese 189-267 aa

XP_057801323.1

295 aa

148

295

Rotamase_3

Rotamase

Rhodanese

PF13616 Rotamase_3 98-177 aa PF00639 Rotamase 99-175 aa PF00581 Rhodanese 189-285 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801322.1`	Pfam	`PF13616`	Rotamase_3	Domain	98	177	6.3e-16	59.6	PPIC-type PPIASE domain
`XP_057801322.1`	Pfam	`PF00639`	Rotamase	Domain	99	175	1.6e-14	55.4	PPIC-type PPIASE domain
`XP_057801322.1`	Pfam	`PF00581`	Rhodanese	Domain	189	267	3.6e-06	28.1	Rhodanese-like domain
`XP_057801323.1`	Pfam	`PF13616`	Rotamase_3	Domain	98	177	5.9e-16	59.7	PPIC-type PPIASE domain
`XP_057801323.1`	Pfam	`PF00639`	Rotamase	Domain	99	175	1.5e-14	55.4	PPIC-type PPIASE domain
`XP_057801323.1`	Pfam	`PF00581`	Rhodanese	Domain	189	285	9.2e-12	46.0	Rhodanese-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945340.1
AGTTTTAAAGATAATGCTTGTAAGTTCTAATTCTAAAAAAATTAGGTGATTAGAGAAAATTGAGAACCCCAACCAATCCCAAAGACATACTCACTTCTACTTGTGCAACTCCAAATCGATCGAATCAAGAAAATTGTGAGCAATGATAAGAGTTTCATCCATTCACCTTTCCCCCTTTGTTAGCCGTTTTCCGCCGCCTATCTTTTCTCTTCTTCCGGCGCTCATTCTTCCATCCTCGCCGCTGCCGCTATCTCACCGGA...

XM_057945339.1
TAAGTTCTAATTCTAAAAAAATTAGGTGATTAGAGAAAATTGAGAACCCCAACCAATCCCAAAGACATACTCACTTCTACTTGTGCAACTCCAAATCGATCGAATCAAGAAAATTGTGAGCAATGATAAGAGTTTCATCCATTCACCTTTCCCCCTTTGTTAGCCGTTTTCCGCCGCCTATCTTTTCTCTTCTTCCGGCGCTCATTCTTCCATCCTCGCCGCTGCCGCTATCTCACCGGAGAACCGCCCACTCCTCGCCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016628
ATGATAAGAGTTTCATCCATTCACCTTTCCCCCTTTGTTAGCCGTTTTCCGCCGCCTATCTTTTCTCTTCTTCCGGCGCTCATTCTTCCATCCTCGCCGCTGCCGCTATCTCACCGGAGAACCGCCCACTCCTCGCCCATTGATCGTCGCAATTCTCTGTTTTTTAGCTCTAAGTTCATTCGGTTTCCGGGAATGTCCGCTCCTAAGCGCAATCTCATTGCCACAGCTTCACTCAGCACCTCGAGCAGCTCTGAAGCTGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057801322.1
MIRVSSIHLSPFVSRFPPPIFSLLPALILPSSPLPLSHRRTAHSSPIDRRNSLFFSSKFIRFPGMSAPKRNLIATASLSTSSSSEAGREILVQHLLVKEEDQKLLLELQKRAAEGEDLSDLAVEHSICPSKEEGGMLGWVTKGQMVPEFEEAAFNAPLNKIVRCKTKFGWHLLQVLSEREESMLADIQPSELHEKMQDPSFLEEAQLIDVREPDEVSIASLPGFKVLPLRQFGSWGPEVATKFDPEKDTYVMCHHGVRSM...

XP_057801323.1
MIRVSSIHLSPFVSRFPPPIFSLLPALILPSSPLPLSHRRTAHSSPIDRRNSLFFSSKFIRFPGMSAPKRNLIATASLSTSSSSEAGREILVQHLLVKEEDQKLLLELQKRAAEGEDLSDLAVEHSICPSKEEGGMLGWVTKGQMVPEFEEAAFNAPLNKIVRCKTKFGWHLLQVLSEREESMLADIQPSELHEKMQDPSFLEEAQLIDVREPDEVSIASLPGFKVLPLRQFGSWGPEVATKFDPEKDTYVMCHHGVRSM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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