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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002471`

染色体: Chr03 坐标: 39175066-39178152 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002471`
名称	SmilChr03G002471
描述	PRA1 family protein A1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	39175066 - 39178152 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016643`
GeneID	`131016643`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016643`
原始查询	`LOC131016643`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PRA1 family protein A1-like
产物	PRA1 family protein A1-like
Arabidopsis	`AT5G05987` (PRA1.A2) prenylated RAB acceptor 1.A2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830485] identity=66; qcov=1; evalue=3.91e-106; confidence=high
Rice	`Os05g0455600` - identity=77.5; qcov=1; evalue=3.98e-122; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF03208 (PRA1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016643

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057801324.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057801324.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.60000	`XP_057801325.1`
4	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057801324.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801324.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:39175480`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:39175523`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B32,C23,C55,D8
`Chr3:39176640`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr3:39176892`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B28,B46,D3
`Chr3:39177070`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr3:39177092`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B82
`Chr3:39177092`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B82
`Chr3:39177095`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801324.1

211 aa

106

211

PRA1

PF03208 PRA1 20-194 aa

XP_057801325.1

209 aa

104

209

PRA1

PF03208 PRA1 20-192 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801324.1`	Pfam	`PF03208`	PRA1	Family	20	194	4.4e-34	117.8	PRA1 family protein
`XP_057801325.1`	Pfam	`PF03208`	PRA1	Family	20	192	7.1e-36	123.6	PRA1 family protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945342.1
GGATAACATTTTTTTGAGTTCTTATATTTTTATTTTGAATTTCCACGTCTCTTCACTGCAATTTCATTTTCTCTACCTAAATTCAACCAACATAAAATTTTGATTCAGATTATTCACATACTATCAATAACATTCAATCAAAAAACACATATATATAATATAATAATAATAAAAAAGCTTCCCTCTCACTCCATCTACGACCAATTTGTCCTCTGCAATCGAAAATTTTTGTTCGTTTTTTTCCTTTTCCGCATAGGTTT...

XM_057945341.1
TTATTTTGAATTTCCACGTCTCTTCACTGCAATTTCATTTTCTCTACCTAAATTCAACCAACATAAAATTTTGATTCAGATTATTCACATACTATCAATAACATTCAATCAAAAAACACATATATATAATATAATAATAATAAAAAAGCTTCCCTCTCACTCCATCTACGACCAATTTGTCCTCTGCAATCGAAAATTTTTGTTCGTTTTTTTCCTTTTCCGCATAGGTTTTCTCGCCCGCGATCAGCCGGATTGAAGAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016643
ATGGATTGGAGTAACGTGACGGCGGAGGATCTGGTGGAGGCGTTGCGAGAAGTGGACTGGTCGTCGCCGCCGCGTCCGTTCTCGGAATTCTTCTCCCGATTCACCGTGCCCCGCTCCCAAGCCAAATGGAGCAGTCGCCTCAAGTGCAATCTCTACTACTACAGGACTAATTATTTCTTGATGATCATTTTCATTCTCGTTTCAGGGATGGGATTTCTTAGGAGGCCGCTTGCTATTGTTGCTGCACTGACGACTGCTAC...

LOC131016643
ATGGATTGGAGTAACGTGACGGCGGAGGATCTGGTGGAGGCGTTGCGAGAAGTGGACTGGTCGTCGCCGCCGCGTCCGTTCTCGGAATTCTTCTCCCGATTCACCGTGCCCCGCTCCCAAGCCAAATGGAGCAGTCGCCTCAAGTGCAATCTCTACTACTACAGGACTAATTATTTCTTGATGATCATTTTCATTCTCGGGATGGGATTTCTTAGGAGGCCGCTTGCTATTGTTGCTGCACTGACGACTGCTACGAGTAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057801324.1
MDWSNVTAEDLVEALREVDWSSPPRPFSEFFSRFTVPRSQAKWSSRLKCNLYYYRTNYFLMIIFILVSGMGFLRRPLAIVAALTTATSIAFLNDSFAATFSEKITRSVRQFSPHLAAKLRAPLAPVIRGRPSTKRAIFICGRPRWVFVLAFSAVSIFLWIVSCGALMVLWALAIGLLATVLHASFRTPNLKARLNTFREEFRAVWRNYSEL

XP_057801325.1
MDWSNVTAEDLVEALREVDWSSPPRPFSEFFSRFTVPRSQAKWSSRLKCNLYYYRTNYFLMIIFILGMGFLRRPLAIVAALTTATSIAFLNDSFAATFSEKITRSVRQFSPHLAAKLRAPLAPVIRGRPSTKRAIFICGRPRWVFVLAFSAVSIFLWIVSCGALMVLWALAIGLLATVLHASFRTPNLKARLNTFREEFRAVWRNYSEL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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