当前解析结果
SmilChr03G002494| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002494 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002494 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G002494 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 39722081 - 39724770 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131016662 |
|---|---|
| GeneID | 131016662 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131016662 |
| 原始查询 | LOC131016662 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131016662 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057801349.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057801349.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057801349.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057801349.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057801349.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:39723755 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B115,B127,B99 |
Chr3:39723759 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 5 | B128,B16,B64,C23,C35 |
Chr3:39723759 |
TG |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 5 | B128,B16,B64,C23,C35 |
Chr3:39723761 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 35 | A25,A7,B102,B122,B123,B127,B14,B23,B28,B35,B38,B44,B45,B5,B55,B56,B69,B85,B96,C31,C33,C38,C42,C49,C50,C57,C58,C67,C69,C73,C74,C80,C83,C84,D10 |
Chr3:39723822 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B8 |
Chr3:39723837 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C61 |
Chr3:39723840 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B34,B4 |
Chr3:39723840 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B34,B4 |
Chr3:39723844 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B8 |
Chr3:39723906 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B40,C40 |
Chr3:39723962 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C74 |
Chr3:39723979 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B40,B89,C39 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。