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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002513`

染色体: Chr03 坐标: 39988747-39991592 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002513`
名称	SmilChr03G002513
描述	actin-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	39988747 - 39991592 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016676`
GeneID	`131016676`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016676`
原始查询	`LOC131016676`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	actin-like
产物	actin-like
Arabidopsis	`AT3G53750` (ACT3) actin 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824542] identity=93.1; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0718100` (ACT1) - identity=92.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	smil04814 (Motor proteins - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00022 (Actin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016676

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	0.80000	`XP_057801367.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057801367.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057801367.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057801367.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801367.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:39989006`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B101,B78,B8
`Chr3:39989033`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B11,B132,C21
`Chr3:39989300`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:39989480`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B103,B38,B48,B97
`Chr3:39989780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B58,B80,C31

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801367.1

377 aa

188

377

Actin

PF00022 Actin 4-377 aa

XP_057801368.1

377 aa

188

377

Actin

PF00022 Actin 4-377 aa

XP_057801369.1

377 aa

188

377

Actin

PF00022 Actin 4-377 aa

XP_057801370.1

377 aa

188

377

Actin

PF00022 Actin 4-377 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801367.1`	Pfam	`PF00022`	Actin	Family	4	377	7.1e-146	486.7	Actin
`XP_057801368.1`	Pfam	`PF00022`	Actin	Family	4	377	7.1e-146	486.7	Actin
`XP_057801369.1`	Pfam	`PF00022`	Actin	Family	4	377	7.1e-146	486.7	Actin
`XP_057801370.1`	Pfam	`PF00022`	Actin	Family	4	377	7.1e-146	486.7	Actin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945387.1
TTTTGCAATCATTAGTTTTTTTTTTTTTTTAATAAATTATACTTTTAATATTAATAAATCTTTATGAAATTATATTACAAATATAGGAGACTGATGCGAGGGGTCAATATTGAGATTCACCCTACAAACATTCTGTACACTAATGCACGAGTCAATCGGAGAAGATAAAGCGAGATTGGAGTTGCATTTAAAGCTGTTGGAAGAACGCCATAACATTCTGTTGTTTCTCTAAATCGCTCGAAATCCTTAGAATCAGAGCA...

XM_057945385.1
TGCAATCATTAGTTTTTTTTTTTTTTTAATAAATTATACTTTTAATATTAATAAATCTTTATGAAATTATATTACAAATATAGGAGACTGATGCGAGGGGTCAATATTGAGATTCACCCTACAAACATTCTGTACACTAATGCACGAGTCAATCGGAGAAGATAAAGCGAGATTGGAGTTGCATTTAAAGCTGTTGGAAGAACGCCATAACATTCTGTTGTTTCTCTAAATCGCTCGAAATCCTTAGAATCAGAGGTCAG...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131016676
ATGGCAGAAGGTGATGATATTCAACCTCTTGTATGCGACAATGGAACTGGAATGGTCAAGGCTGGGTTTGCTGGAGATGATGCTCCTCGTGCCGTGTTCCCTAGCATTATAGGGCGGCCGCGCCACACAGGTGTGATGGTGGGCATGGGGCAGAAAGATGCATATGTTGGGGATGAGGCACAATCCAAGAGAGGTATTCTATCTCTCAAGTACCCAATTGAGCATGGTATTGTTAACAATTGGGATGACATGGAGAAGAT...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057801367.1
MAEGDDIQPLVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIIGRPRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILSLKYPIEHGIVNNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPILLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNSPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVSHTVPIYEGYSLPHAILRLDLAGRDLTEFFAKILTERGYSFTTSAEKEIVRDMKEKLTYIALDFEQEMETAKTSSDIEKNYELPDGQVITIGNERFRCP...

XP_057801368.1
MAEGDDIQPLVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIIGRPRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILSLKYPIEHGIVNNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPILLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNSPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVSHTVPIYEGYSLPHAILRLDLAGRDLTEFFAKILTERGYSFTTSAEKEIVRDMKEKLTYIALDFEQEMETAKTSSDIEKNYELPDGQVITIGNERFRCP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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