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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000467`

染色体: Chr01 坐标: 9580575-9582111 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000467`
名称	SmilChr01G000467
描述	uncharacterized SmilChr01G000467
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	9580575 - 9582111 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016677`
GeneID	`131016677`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016677`
原始查询	`LOC131016677`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=25.9; qcov=0.713; evalue=2.77e-34; confidence=low
Rice	`Os12g0597300` - identity=26; qcov=1.09; evalue=1.1e-40; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016677

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057801399.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057801399.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801399.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801399.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801399.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:9580597`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr1:9580629`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B138,B24,B68,C85
`Chr1:9580629`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B138,B24,B68,C85
`Chr1:9580635`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B71,B75,C49,C71
`Chr1:9580639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr1:9580644`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A11,B19,B36,B57,B64,B86,C46,C62,C66,C69,C75
`Chr1:9580651`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:9580665`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B59,B98,C19,C56,C59
`Chr1:9580680`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B63
`Chr1:9580699`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B117,B17,B2,C60
`Chr1:9580704`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B26,C15,C29,D10,D5
`Chr1:9580711`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801399.1

439 aa

220

439

Transposase_mut

MULE

PF00872 Transposase_mut 134-233 aa PF10551 MULE 136-230 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801399.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	134	233	1e-10	41.8	Transposase, Mutator family
`XP_057801399.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	136	230	4.3e-21	75.8	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945416.1
ATGTGGAGGATTACAAATCTGACGTTGGATCATAGTTGCTATACGGACTTGGATCGAAGGGTTGCAAGACAGGTGACTGCAAAGGTTGCAGCTAGTTATTTTGCTCGTAGATTGGTTGACGAAGGGTGTGTTTTGAGGCTGAAGGAGATGATCGATGAGATGCTTCGATTACACGGGATTAAAATGATGTATAGCCTTGCTTTGCGAACGCGGAGCTTAGCTATAGACATGACAAATGGCGACTTCGAAAAGTCATATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016677
ATGTGGAGGATTACAAATCTGACGTTGGATCATAGTTGCTATACGGACTTGGATCGAAGGGTTGCAAGACAGGTGACTGCAAAGGTTGCAGCTAGTTATTTTGCTCGTAGATTGGTTGACGAAGGGTGTGTTTTGAGGCTGAAGGAGATGATCGATGAGATGCTTCGATTACACGGGATTAAAATGATGTATAGCCTTGCTTTGCGAACGCGGAGCTTAGCTATAGACATGACAAATGGCGACTTCGAAAAGTCATATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801399.1
MWRITNLTLDHSCYTDLDRRVARQVTAKVAASYFARRLVDEGCVLRLKEMIDEMLRLHGIKMMYSLALRTRSLAIDMTNGDFEKSYQRIPSYLYLLRERNPETIYNYQTTHEDVFLHMFVAIGQCIRAFESSLRPIIVVDGTHLKGRNRGVLFVVVTKDGNEQIFPLAIGLGPIENDESWTWFLSNLRRCYNPPKGLMIVSDQHKSIENAIRYVYPNAAHGLCYHHLHKNLTRIGKEALIHFKNAAYAYRVEGFGKFFSE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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