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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002539`

染色体: Chr03 坐标: 40549220-40551276 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002539`
名称	SmilChr03G002539
描述	uncharacterized SmilChr03G002539
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	40549220 - 40551276 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016700`
GeneID	`131016700`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016700`
原始查询	`LOC131016700`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0285100; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os03g0285100; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G53470` (AT3G53470) 2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824515] identity=52.3; qcov=0.748; evalue=1.03e-28; confidence=medium
Rice	`Os03g0285100` - identity=73.4; qcov=0.552; evalue=1.74e-36; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016700

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057801385.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.60000	`XP_057801385.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801385.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801385.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801385.1`

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EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:40549265`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	C2,C53,C54
`Chr3:40549265`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	C2,C53,C54
`Chr3:40549281`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	27	A11,A14,A19,A5,A7,A9,B126,B130,B138,B32,B33,B4,B58,B62,B67,B7,B80,B82,B97,C31,C46,C51,C53,C65,C73,C80,C87
`Chr3:40549451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr3:40550981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B58,B80,C31

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945402.1
ATGAAATGCGATTTCCTCAACGAGTCACTCCAACAGTCTCCACTCTCCAGCTTTACAATTTTCCCACAACTAAAAATAATTCTGCGGCTAAAAATTGCAGAATCCATTGAAGCAGCCATGGATATTCGACTTCGAATCGGAAGCCTATATTCTCACACTTGTCTCAATCTCACATCAAATTCCAAATTTCTCAAACCGCGCTGCGCGAGAGGGCCACCTCCTCAGCAAAATGACGACAACAGTAACGATGATAAATTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016700
ATGAAATGCGATTTCCTCAACGAGTCACTCCAACAGTCTCCACTCTCCAGCTTTACAATTTTCCCACAACTAAAAATAATTCTGCGGCTAAAAATTGCAGAATCCATTGAAGCAGCCATGGATATTCGACTTCGAATCGGAAGCCTATATTCTCACACTTGTCTCAATCTCACATCAAATTCCAAATTTCTCAAACCGCGCTGCGCGAGAGGGCCACCTCCTCAGCAAAATGACGACAACAGTAACGATGATAAATTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801385.1
MKCDFLNESLQQSPLSSFTIFPQLKIILRLKIAESIEAAMDIRLRIGSLYSHTCLNLTSNSKFLKPRCARGPPPQQNDDNSNDDKFSRDWDKAWSSFKKKGKKTLFSGFSPDKYVSWNPRRSEYPLSEEVDPIKRSERSNLMD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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