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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002548`

染色体: Chr03 坐标: 40648123-40656008 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002548`
名称	SmilChr03G002548
描述	uncharacterized SmilChr03G002548
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	40648123 - 40656008 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016707`
GeneID	`131016707`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016707`
原始查询	`LOC131016707`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0835000; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0835000; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G55020` (AT3G55020) Ypt/Rab-GAP domain of gyp1p superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824668] identity=54.6; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0835000` - identity=55.9; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00566 (RabGAP-TBC); PF23436 (RabGap-TBC_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016707

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057801389.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057801390.1`
3	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.40000	`XP_057801390.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801389.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801389.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:40648305`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B31
`Chr3:40649081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr3:40650249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr3:40651431`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B70,B80
`Chr3:40651656`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr3:40653799`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr3:40654494`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B5,B57
`Chr3:40654695`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr3:40654699`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B22,C50
`Chr3:40654738`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,C34
`Chr3:40654749`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C77
`Chr3:40654817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801389.1

773 aa

386

773

RabGAP-TBC

RabGap-TBC_2

PF00566 RabGAP-TBC 241-458 aa PF23436 RabGap-TBC_2 319-476 aa

XP_057801390.1

739 aa

370

739

RabGAP-TBC

RabGap-TBC_2

PF00566 RabGAP-TBC 241-458 aa PF23436 RabGap-TBC_2 319-476 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801389.1`	Pfam	`PF00566`	RabGAP-TBC	Family	241	458	1.5e-55	189.0	Rab-GTPase-TBC domain
`XP_057801389.1`	Pfam	`PF23436`	RabGap-TBC_2	Domain	319	476	2.1e-28	100.2	RabGAP TBC domain
`XP_057801390.1`	Pfam	`PF00566`	RabGAP-TBC	Family	241	458	1.3e-55	189.1	Rab-GTPase-TBC domain
`XP_057801390.1`	Pfam	`PF23436`	RabGap-TBC_2	Domain	319	476	1.9e-28	100.3	RabGAP TBC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945406.1
AAAGCACCACAAATTACAAAATGCAAGCGGTCAACTCTAGAGAGAGAGCGCGAAAGAGAGGGAAAATCAGTTAACTGTTAGAAGAGATGACCAATCGATCACTACGGAAACTGCACTCTGCGTCGTCACGTATATTGTCGCATGCAATATGCTTCAACTCTATACGTCTGATTTTTCTGCGACTTTTGAGCTCGACACGTGTGGCTATGCCCTGCGTTTCCGCGGTTTTCAGGATTCGATATTTGAGGAAATTCTTAAGT...

XM_057945407.1
AAAGCACCACAAATTACAAAATGCAAGCGGTCAACTCTAGAGAGAGAGCGCGAAAGAGAGGGAAAATCAGTTAACTGTTAGAAGAGATGACCAATCGATCACTACGGAAACTGCACTCTGCGTCGTCACGTATATTGTCGCATGCAATATGCTTCAACTCTATACGTCTGATTTTTCTGCGACTTTTGAGCTCGACACGTGTGGCTATGCCCTGCGTTTCCGCGGTTTTCAGGATTCGATATTTGAGGAAATTCTTAAGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016707
ATGTTGTTGTCCTTGTTGAGCAAGCGTACATTATATGATGATTCCAGGGATTCCTATGGATTTACTGTGAGACCTCAACATGCCCATAGGTATCGAGAGTATTCCAATATCTATAAGGAAGAAGAAGAGGAGAGATTGGCAAAATGGAAGGGATTTCTTGTGCAGCAAGAAGAGTCTACAAGGGCTAGTCATGCTAAGGAAGATGAAACTGAACCTGTGGTTTCTGAGGTTGCAGAGCAGTCACGTGATCTCGGTCAAAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057801389.1
MLLSLLSKRTLYDDSRDSYGFTVRPQHAHRYREYSNIYKEEEEERLAKWKGFLVQQEESTRASHAKEDETEPVVSEVAEQSRDLGQTASEERDDSAEQSAAISEVTAVEKVSGDDGNSSEKRSEGSVPPKEAPSNQNRKPREVKTWADISQSLNCIDHLMSLRIKKKGSVKRENKRCENNDLPSIDEARSDSGGSEDDNERNDSADAPTVETSANDKLPPETSFPWKEELAALVRLGVPKELRGEVWQAFVGVRTRRVDG...

XP_057801390.1
MLLSLLSKRTLYDDSRDSYGFTVRPQHAHRYREYSNIYKEEEEERLAKWKGFLVQQEESTRASHAKEDETEPVVSEVAEQSRDLGQTASEERDDSAEQSAAISEVTAVEKVSGDDGNSSEKRSEGSVPPKEAPSNQNRKPREVKTWADISQSLNCIDHLMSLRIKKKGSVKRENKRCENNDLPSIDEARSDSGGSEDDNERNDSADAPTVETSANDKLPPETSFPWKEELAALVRLGVPKELRGEVWQAFVGVRTRRVDG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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