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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002556`

染色体: Chr03 坐标: 40738500-40741310 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002556`
名称	SmilChr03G002556
描述	uncharacterized SmilChr03G002556
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	40738500 - 40741310 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016715`
GeneID	`131016715`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016715`
原始查询	`LOC131016715`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0282800; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os03g0282800; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G53490` (AT3G53490) valine-tRNA ligase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824517] identity=49.8; qcov=0.913; evalue=4.12e-63; confidence=high
Rice	`Os03g0282800` - identity=48.7; qcov=0.959; evalue=1.02e-70; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF25829 (DUF7953)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016715

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.80000	`XP_057801400.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057801400.1`
3	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057801400.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057801400.1`
5	Endosome	内体	0.20000	`XP_057801400.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:40738775`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,D11
`Chr3:40738834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr3:40739485`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B127,C20,C27
`Chr3:40739527`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,C8,C82
`Chr3:40740218`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B69,B97,C38
`Chr3:40740754`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,C20,C27,D11
`Chr3:40740818`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B78,B98,D11
`Chr3:40740869`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,C20,C27,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801400.1

242 aa

121

242

DUF7953

PF25829 DUF7953 32-144 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801400.1`	Pfam	`PF25829`	DUF7953	Domain	32	144	4e-59	198.3	Domain of unknown function (DUF7953)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945417.1
CCAACCGAAGCCTCACTGGTTCAACCTCGTATGCGAAGCGTACAACCTTAACGACCTTAAATAACCAACGCGCGAGCTCCTTTTTCTTCCCCCTTCAGTTGTCTCCTTCCCACGCCAAGGTTTCACGTCAAAAGAAAAAAAGAAAATAATAATAATAAAGGAAAATTCTGCTCAAGCCCTAATTTGGATCGAGCAATACTCCGGTGATTATTATTTTCGATATATCTATTGATTTGAATACCGAGGTGGCGAGGATTGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016715
ATGATTCGCCGTCGATTGATATTGAGGGTTCCCTTGTTGGTTTTTTATTCATGCACGATTCTTCTCAGCTATTCCGCAGCTTTTATATCAGCCTCAGTTGTCACGCTTGATTCTATCGAGATCTTCAAAACTCATGAATGGATTCCGACCAAACCGAAAGTTTACTTTAAGTGTAAAGAAGAGGGTGAGATAATTCTACCAGATGTTAAAGAAAAGCATGTATTGTATTCCTTCAGAGGTGAAGAATCGTGGCAGCCTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801400.1
MIRRRLILRVPLLVFYSCTILLSYSAAFISASVVTLDSIEIFKTHEWIPTKPKVYFKCKEEGEIILPDVKEKHVLYSFRGEESWQPLTELPDIKCKRCGLYEKDAIRSNYVFDEWELCASDFTRSDGKYIHIKEKEFNATFLCKECVALAKASAAASSSAADKEKDNSSKAKQEESSKMLPWPLILVISCACLILFTGGLVAGCKWWQRRKRLQQQAQFLKLFEDADDIEDELGIGPLSHTV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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