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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002557`

染色体: Chr03 坐标: 40741252-40744477 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002557`
名称	SmilChr03G002557
描述	uncharacterized SmilChr03G002557
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	40741252 - 40744477 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016716`
GeneID	`131016716`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016716`
原始查询	`LOC131016716`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc/iron-chelating domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831827]; symbol=AT5G02710; hit=AT5G02710; species=arabidopsis; confidence=high
产物	zinc/iron-chelating domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831827]; symbol=AT5G02710; hit=AT5G02710; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G02710` (AT5G02710) zinc/iron-chelating domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831827] identity=55.2; qcov=1.04; evalue=2.56e-65; confidence=high
Rice	`Os03g0363400` - identity=55.1; qcov=0.765; evalue=1.54e-47; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03692 (CxxCxxCC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016716

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057801401.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057801401.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057801401.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801401.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801401.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:40743645`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:40743652`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,C28
`Chr3:40743726`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801401.1

166 aa

166

CxxCxxCC

PF03692 CxxCxxCC 49-137 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801401.1`	Pfam	`PF03692`	CxxCxxCC	Family	49	137	2.8e-11	44.6	Putative zinc- or iron-chelating domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945418.1
ATCTCTATCCTTGTTACCAACACCCACACACCAAACAGAAGCCCTTCTTCACGAATTTAACGTCGTGCTCCACTGCTCTGTTGTTGCAACAGCACGCCGCCGACTCTGTTTATCCCCACTGATTTCGCATTCAGTTCAAGTTCAATTTTCGCAATGTCACACGCCCTGACGATGATGGTTCAGTCGCCGGCGTGTTTCGCCGCGAAGAAAAAGTCACCACCTCCGCCACCGCCTAAAACCCAACGGCAGAAATCCGCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016716
ATGTCACACGCCCTGACGATGATGGTTCAGTCGCCGGCGTGTTTCGCCGCGAAGAAAAAGTCACCACCTCCGCCACCGCCTAAAACCCAACGGCAGAAATCCGCCACCCATGGGTTCGGCGGCGAGAAGAAAACTCCCGTGTGGCAATGCGTGGAGAAGTGCGGCGCATGCTGCAAACTCGACAAGGGCCCCACTTTTCCTTCCCCTGAAGAAATATTCGACGACCCTTCTGATGTCGAGCACTACAATAGCTTGGTTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801401.1
MSHALTMMVQSPACFAAKKKSPPPPPPKTQRQKSATHGFGGEKKTPVWQCVEKCGACCKLDKGPTFPSPEEIFDDPSDVEHYNSLVGQDGWCIHYDKSSRKCSIYADRPYFCRVEPEIFHRLYGIDKKRFNKEACSCCADTIKTVYGTNSQELEKFNNAIWSKSSK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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