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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002594`

染色体: Chr03 坐标: 41242315-41243161 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002594`
名称	SmilChr03G002594
描述	uncharacterized SmilChr03G002594
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	41242315 - 41243161 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016752`
GeneID	`131016752`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016752`
原始查询	`LOC131016752`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0256300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os11g0256300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os11g0256300` - identity=42.9; qcov=0.467; evalue=4.37e-11; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF06839 (Zn_ribbon_GRF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016752

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057801455.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057801455.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057801455.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801455.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801455.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:41242590`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr3:41242607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr3:41242636`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,A5,B17,B30,C80
`Chr3:41242709`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,C70
`Chr3:41242734`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	A8,B15,B35,B54,C28,C37,C70
`Chr3:41242746`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr3:41242960`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	A19,B48,C43,C49
`Chr3:41242960`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	4	A19,B48,C43,C49
`Chr3:41242966`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr3:41242970`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,B2,B59,C50,C78
`Chr3:41242976`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr3:41243000`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801455.1

135 aa

135

Zn_ribbon_GRF

PF06839 Zn_ribbon_GRF 18-57 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801455.1`	Pfam	`PF06839`	Zn_ribbon_GRF	Domain	18	57	8.6e-08	32.9	GRF zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945472.1
TCTTCTGGATATAACAAATCGAGGTAAGAACATGAGTTTGAACTCAGGATTTGGGTCCTGATCGTCACGTGGTCGAAGGCAGATGGATGCTGAGCATGGGAGTAATTACGTGTATTGTCGTTGCGAGTTTGAAGGCAGGAGGCTTCAAGCTCCGAGAATTACCTCATGGACAGACGACAACCCCGGGAGAAGGTTCTACGGATGTAGAAATTGGAGAATGAAAAATTGTGGTTTTTTCGTCTGGTATGACGAGCCCATGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016752
ATGGATGCTGAGCATGGGAGTAATTACGTGTATTGTCGTTGCGAGTTTGAAGGCAGGAGGCTTCAAGCTCCGAGAATTACCTCATGGACAGACGACAACCCCGGGAGAAGGTTCTACGGATGTAGAAATTGGAGAATGAAAAATTGTGGTTTTTTCGTCTGGTATGACGAGCCCATGTGTGAGAGAGCTAGAGAAGTGATAAATTACTTGAAGAATGAAAATATGAAGCTCTTAAGGATCTATCAACGTTCGGCCTCCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801455.1
MDAEHGSNYVYCRCEFEGRRLQAPRITSWTDDNPGRRFYGCRNWRMKNCGFFVWYDEPMCERAREVINYLKNENMKLLRIYQRSASPLDVENEIDNLWNVMEGLKEESRKVRRKNTIVVMVLIVSWLMIGYVVLA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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