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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002604`

染色体: Chr03 坐标: 41429637-41432804 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002604`
名称	SmilChr03G002604
描述	PWWP domain-containing protein 5-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	41429637 - 41432804 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016761`
GeneID	`131016761`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016761`
原始查询	`LOC131016761`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PWWP domain-containing protein 5-like
产物	PWWP domain-containing protein 5-like
Arabidopsis	`AT5G02950` (AT5G02950) Tudor/PWWP/MBT superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831728] identity=33.5; qcov=0.688; evalue=3.2e-78; confidence=low
Rice	`Os05g0463500` - identity=46; qcov=0.228; evalue=7.35e-47; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00855 (PWWP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016761

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057801467.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801467.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801467.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801467.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057801467.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:41430135`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B69,C23,C38
`Chr3:41430175`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B135
`Chr3:41430175`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B135
`Chr3:41430439`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B135,C77
`Chr3:41430602`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,C31
`Chr3:41430630`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr3:41430774`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:41430788`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr3:41431036`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B102,B35,B44,B53
`Chr3:41431269`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B73,C47,C78
`Chr3:41431295`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr3:41431320`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B42,B43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801467.1

830 aa

415

830

PWWP

PF00855 PWWP 257-339 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801467.1`	Pfam	`PF00855`	PWWP	Domain	257	339	9.4e-18	65.2	PWWP domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945484.1
GCTTCTCCATTTCCACCAAAATCAACAGCGAAAAACTAAATGAAAAAAGAAAAGAAAAGGGGGAAATACGTCGATTTCTCTATTCCGCGGCTCCCAAAGAATAGCAGAAAACAAAGTTAGTTATTCAAAACTCGTGAATTTCAGTTCCTTCAATCACTTGAGGGTTCATTTCTAATCTGATGAATTTGAAAATTGACGTGAGTTCCTTGATTTCTGCTACTGTTTCGGGGGGAATTAGACAAGGGGGTGATTTGGTGACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016761
ATGGAGATTTCTGGTGATAAGGGGGCTTTGAGTGGTGGAGTTAGGGTTTCGGAGGAGTCTAAGGTTTCGACTGGTGAGTCAAACAGGGGGACTGTAATTAGTGCATCTGAGAGCAAGTCTGTTGAATCTAGTAACTTAGGAAGCAATGATGTAAGTCAAAATCAGAGTGCGGATAAGGTATCTCGCAACGATAGGTGGGAATCATGGGGGGTTATGAATATGGTTGGCAAAGTGCTCGGTGGAAAGCTTTATGTGGATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801467.1
MEISGDKGALSGGVRVSEESKVSTGESNRGTVISASESKSVESSNLGSNDVSQNQSADKVSRNDRWESWGVMNMVGKVLGGKLYVDDEVEDVNDSENGGQVTVVGGAEALQDVIVERTSENRGGVNLVADMNVHEDVMWEPSNGVDMKRMDINSDSAKLDLDCPVEGNNNGNSDMVSCGIVPDGNLETEEINDVKDDMLRSEGFGKNKEVNDVKADVSMPKGDGELDLHINDVKPGMLIPEECSGKTEKEGEYNVSDLVW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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