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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002605`

染色体: Chr03 坐标: 41438962-41444298 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002605`
名称	SmilChr03G002605
描述	uncharacterized SmilChr03G002605
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	41438962 - 41444298 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016762`
GeneID	`131016762`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016762`
原始查询	`LOC131016762`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mediator of RNA polymerase II transcription subunit-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824500]; symbol=AT3G53320; hit=AT3G53320; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	mediator of RNA polymerase II transcription subunit-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824500]; symbol=AT3G53320; hit=AT3G53320; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G53320` (AT3G53320) mediator of RNA polymerase II transcription subunit-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824500] identity=43; qcov=0.187; evalue=7.23e-29; confidence=weak
Rice	`Os05g0121800` - identity=44.7; qcov=0.16; evalue=4.43e-20; confidence=weak
GO	GO:0008017 (microtubule binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016762

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	1.00000	`XP_057801468.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057801468.1`
3	Spindle	Spindle	0.40000	`XP_057801468.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057801468.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801468.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:41439156`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B117,B20,C1
`Chr3:41439165`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr3:41439186`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr3:41440049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B77
`Chr3:41440101`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr3:41441726`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B52,C55,D8
`Chr3:41441731`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	12	A23,B10,B118,B140,B59,B86,B91,B97,C40,C59,C8,D4
`Chr3:41442023`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B78,C44,D6
`Chr3:41442039`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr3:41442049`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B46,C6,C72,C86
`Chr3:41442164`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr3:41442354`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945485.1
CTCGACAGTTCAAAATATTTCCTTTTGCTTCTCTCTCTCCAAATTCTCCCCACTCTATCATTGTTCACTGCCGATCTGAAATCCAAGATCTCGATCGAAACAAGGAACTCGCGGTGCAAATTGAAGACTAGTTCTTCGATTAATCGAGAAAAATGGAGATTGGTGGCTGTCAAGAGATAGATCTTGAACTTGAAGCCGACGACCTCATTGGAAATTTTCAGTTTCCAGAAACTTCTGATGCTAACAAAGAAGTTAATAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016762
ATGGAGATTGGTGGCTGTCAAGAGATAGATCTTGAACTTGAAGCCGACGACCTCATTGGAAATTTTCAGTTTCCAGAAACTTCTGATGCTAACAAAGAAGTTAATAGTGTTGGCATTGATGTTAAAGATCGCTTGCCTGAGCTGCATGAATCGACAGAGCCTGAAAGAAACCAAAGAAATGGAAGGTATAACTTGCGAAAAAGCCTAGCCTGGGACAGTGCCTTCTTCACTAGTGCAGGAGTGCTAGACGCAGAAGAATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801468.1
MEIGGCQEIDLELEADDLIGNFQFPETSDANKEVNSVGIDVKDRLPELHESTEPERNQRNGRYNLRKSLAWDSAFFTSAGVLDAEELSSMITKLDKKEKRILPGIQEELTGSTESISTLQSDSLTLESNDDDLFLDIRASIQRSSRKVSNLTNSNSKIAAMVLDDRAISSPKKEDSVSQNKCPKPGVKKTSSLQTVRMSKSQLKPIAKLTPGRSIKPDSAQSQAGEINLVSAKPLKTISSSVPSSTAAKRESVGVGRVKP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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