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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002613`

染色体: Chr03 坐标: 41530122-41532042 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002613`
名称	SmilChr03G002613
描述	protein OSB4, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	41530122 - 41532042 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016768`
GeneID	`131016768`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016768`
原始查询	`LOC131016768`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein OSB4, chloroplastic-like
产物	protein OSB4%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G44785` (OSB3) organellar single-stranded DNA binding protein 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834508] identity=30.1; qcov=0.868; evalue=8.08e-48; confidence=low
Rice	`Os01g0949060` (B1147A04.4-2) - identity=31.1; qcov=0.585; evalue=1.34e-27; confidence=low
GO	GO:0003697 (single-stranded DNA binding); GO:0006264 (mitochondrial DNA replication); GO:0042645 (mitochondrial nucleoid); GO:0051096 (positive regulation of helicase activity)
KEGG	-
Pfam	PF30937 (OSB_PDF); PF30940 (OSB_SSB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016768

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057801480.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801480.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801480.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801480.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801480.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:41530419`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B103
`Chr3:41530419`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B103
`Chr3:41530470`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr3:41530515`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B94
`Chr3:41530515`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B94
`Chr3:41530963`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr3:41531138`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B127,C20,C27
`Chr3:41531335`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,C19,D11
`Chr3:41531620`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B76,B94,C36,C49
`Chr3:41531727`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B115,B138,C34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801480.1

494 aa

247

494

OSB_SSB

OSB_PDF

PF30940 OSB_SSB 77-176 aa PF30937 OSB_PDF 279-335 aa PF30937 OSB_PDF 431-479 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801480.1`	Pfam	`PF30940`	OSB_SSB	Domain	77	176	7.3e-26	91.0	OSB SSB domain
`XP_057801480.1`	Pfam	`PF30937`	OSB_PDF	Repeat	279	335	6.2e-45	151.2	OSB PDF repeat
`XP_057801480.1`	Pfam	`PF30937`	OSB_PDF	Repeat	431	479	6.2e-45	151.2	OSB PDF repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945497.1
ATAAAAAATATGAAAACCTAAAACAATGTATTTGGAAAAAAAATGTATTTTCAAAACAATGTCTAAATTCCCACCCAAGCCAAAACCCTGCATAAACCCTAGTTGAAACAGCCCCCAATTGTTCTCTGAATCAATTAACCATGAATTTACTTTTCAGAGCAAAATTATCCGGCCGAATCCGCCTCTCCCTTTCACCACTTTCTTCCCTTCAACAATCGTATTCCTATGCCACCTCAAAAACCCCTAAACCAACCAGCCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016768
ATGAATTTACTTTTCAGAGCAAAATTATCCGGCCGAATCCGCCTCTCCCTTTCACCACTTTCTTCCCTTCAACAATCGTATTCCTATGCCACCTCAAAAACCCCTAAACCAACCAGCCCTAAATCCCAGAAATCTTCCACACCATCATCGAGTTTTTCTGAGAGAATCAAGAAACCGACGGGTGACGTGATCGTTTGGCCCAAGCCGAGCGAGATTCCGTATCAAGCGAAAGTTGCTAATTTTGTAAAATTGATCGGATA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801480.1
MNLLFRAKLSGRIRLSLSPLSSLQQSYSYATSKTPKPTSPKSQKSSTPSSSFSERIKKPTGDVIVWPKPSEIPYQAKVANFVKLIGYVNVPVQFDTLPGGKHYATTAISQEISDGRDPVLIAAVFEGDLAHVVASHVKVNDCVLVSGQLSSEPLLRFAKGDGFGRLHILGENLNFVEGFTRRVSSKKSEGSVFAVGIEKNVVEGVDDGKFEQQWEKALDDAKVKKFSGETNWGSGTVSVESNVGTKGAMPGSGEAKLEKG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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